Публикации по теме 'survival-analysis'
Стратифицированная модель пропорциональной регрессии рисков Кокса
Стратифицированная модель пропорциональной регрессии рисков Кокса
Учебное пособие по созданию стратифицированной модели Кокса с использованием Python и Lifelines.
Модель пропорциональных рисков Кокса используется для изучения влияния различных параметров на мгновенную опасность, с которой сталкиваются люди или «вещи».
Модель Кокса делает следующие предположения о вашем наборе данных:
Все люди или объекты в наборе данных подвержены одинаковому базовому уровню опасности...
Вопросы по теме 'survival-analysis'
R survdiff порядок групп
Если у меня есть объект survdiff в R, есть ли быстрый способ определить, какая группа имеет наилучшее выживание (если есть значительная разница)?
По сути, я перебираю строки фрейма данных и каждый раз получаю значение survdiff p, но на самом деле...
485 просмотров
schedule
11.09.2022
Средняя выживаемость
Я пытаюсь использовать пакет выживания в R, чтобы запустить тест логарифмического ранга для средних показателей выживаемости - возможно ли это? Я использую код:
survdiff(surv(Age, Survival) ~ Treatment, data = GBM)
где Возраст = возраст на...
724 просмотров
schedule
30.04.2023
Как извлечь информацию о формуле и подмножестве из вызова функции
В своей текущей работе я часто использую функцию Survfit () для вычисления оценки Каплана-Мейера для данных о выживаемости и выполняю тест логарифмического ранга с помощью функции Survdiff ().
Я хотел бы знать, как я могу извлечь информацию о...
1025 просмотров
schedule
08.04.2022
Как использовать строковую переменную в анализе выживания в R?
Я хочу применить параметрический анализ выживаемости в R. Мои данные - это данные исследования рака легких ветерана. Вот первые 20 столбцов данных:
Думаю, мне нужно преобразовать celltype в категориальные фиктивные переменные, как это...
385 просмотров
schedule
01.04.2023
начальные оценки Каплана-Мейера или анализ выживаемости
По оценкам Каплан-Мейера, можно ли провести бутстрап в анализе выживаемости?
Если да, то как мне это сделать?
Я прочитал несколько статей, но они слишком сложные. В R есть функция под названием BootKM, может ли кто-нибудь вкратце объяснить, как...
965 просмотров
schedule
20.12.2022
Графики линии жизни R для анализа выживания
Я хотел бы построить диаграмму линий жизни для своих данных, чтобы читатели могли понять, как формируются данные и что правильная цензура делает с данными.
В идеале я бы хотел, чтобы это выглядело примерно так [это][1]
Мне нужна горизонтальная...
140 просмотров
schedule
17.07.2022
R: Допущение пропорционального риска в coxme()
Я запускаю модель смешанных эффектов, используя функцию coxme() в R. Модель анализирует событие успеха продукта фирм в разных странах. К фиксированным эффектам относятся, например, ВВП, население, технологии и культурные переменные. Случайные...
608 просмотров
schedule
21.08.2022
Как экспортировать значения графика X и Y из графика R?
Используя пакеты eha и survival в R, я использую следующий код для создания графика выживания ниже:
with(dataset, plot(Surv(enter, exit, event), ylim= c(0.87, 1.0), fn = "surv", strata = Gender))
Вместо того, чтобы экспортировать...
879 просмотров
schedule
06.04.2022
Почему в R функции length() и nrow() возвращают разные значения объекта Surv?
У меня есть этот объект Surv с именем y1. Когда я вызываю для него функции length() и nrow(), я получаю разные значения. При осмотре y1, кажется, имеет количество элементов, которое возвращает nrow(). Почему length() не работает?
y1 <-...
130 просмотров
schedule
05.03.2023
Как я могу получить вывод кумулятивного коэффициента опасности от coxph?
Как я могу получить вывод кумулятивного коэффициента опасности от coxph?
У меня есть моя модель
coxfit <- coxph(Surv(combi$survival, combi$realdeath) ~ combi$meanrr, combi)
и получить результат
# Call:
# coxph(formula =...
6252 просмотров
schedule
08.05.2024
Создание набора данных для анализа выживаемости
Я пытаюсь выполнить анализ выживаемости, используя пакет выживания в R.
У меня есть набор данных, который выглядит так, и его можно создать с помощью следующего кода.
event <- c(1,0,0,1,0,1)
time <-c(8,50,100,200,300, 1)
id <-...
675 просмотров
schedule
12.05.2022
R изменение формы/расширение набора данных с использованием survSplit для получения переменной во времени для регрессии Кокса
Я видел другие вопросы, подобные этому, но они не отвечают на мой вопрос. Я хочу расширить свой набор данных, так как мне нужно создать изменяющуюся во времени переменную для анализа выживания и использовать команду survSplit (пакет survival ), но...
391 просмотров
schedule
07.12.2022
Цвет по другой переменной, чем используется для кривых в ggsurvplot() из пакета survminer
При построении графика с помощью ggsurvplot() хотелось бы раскрасить кривые выживания категориальной переменной, которая представляет собой надмножество категориальных переменных, используемых для определения кривых (слоев). Я прочитал всю...
3281 просмотров
schedule
05.08.2022
Оценка выживаемости с помощью обобщенной гамма-функции в flexsurv не удалась
У меня есть данные о выживаемости пациентов. Некоторые из них подвергнуты цензуре. Я хочу подогнать обобщенную гамма-функцию к эмпирическим данным с помощью пакета flexsruv в R. В то время как все другие функции, которые я хочу подогнать (такие...
587 просмотров
schedule
13.06.2023
R - применить сурфит к списку и построить график с соответствующими именами
У меня есть список именованных фреймов данных:
library(survival)
library(survminer)
surv.days<- runif(n = 50, min = 0, max = 500)
censor<- sample(c(0,1), 50, replace=TRUE)
survdata<- data.frame(surv.days, censor)
survlist<-...
444 просмотров
schedule
07.10.2022
R: Создание вероятности/проекции каждый месяц в зависимости от вероятностей выживания.
У меня есть данные по идентификатору по месяцам, и для каждого месяца у меня есть вероятность оттока клиентов, как показано ниже.
Как я могу получить вероятность оттока каждый месяц в зависимости от вероятности выживания в предыдущем месяце?...
33 просмотров
schedule
12.03.2023
Предел прогноза при нормальной регрессии и регрессии выживания
Я пытаюсь предсказать, через какое время протекут газовые трубы. Я использовал 15 признаков, самым важным из которых является «год установки трубы». Последние данные об утечке, которые у меня есть, относятся к утечке, которая произошла в 2017 году,...
35 просмотров
schedule
24.08.2022
Что предсказывает выживание?
Я пытаюсь разработать прогностическую модель, используя данные о выживаемости рака, и использовал пакет R survivalsvm , который использует метод SVM. После запуска следующего кода я получил некоторые результаты, но мне было трудно их...
420 просмотров
schedule
04.01.2023
Как построить трехмерную плоскость риска в R?
Я пытаюсь построить плоскость риска на трехмерном графике в языке R, чтобы графически изобразить изменение влияния непрерывного предсказателя на связь между некоторым другим непрерывным предсказателем и результатом. Оценки риска (HR, отношение...
107 просмотров
schedule
12.03.2022
В R Studio моя таблица рисков удаляется из моего графика выживания, когда я добавляю линию пересечения. Есть ли способ преодолеть эту проблему?
В R Studio моя таблица рисков удаляется из моего графика выживания, когда я добавляю линию пересечения. Есть ли способ преодолеть эту проблему? Мой исходный код, который показывает таблицу рисков:
library(readxl)
library(ggplot2)...
195 просмотров
schedule
30.05.2023
