Вопросы по теме 'simpleitk'
itk::NeighborhoodIterator обертка Python
Я использую оболочку ITK python (ITK не simpleITK) для создания прототипа автоматической обработки вывода µCT. Мне нужно вычислить карту толщины 3D-объекта, но эта функция не существует как есть в ITK. Конвейер прост:
Бинаризировать объект...
238 просмотров
schedule
11.05.2023
SimpleITK: применить обратное преобразование
Недавно я начал использовать SimpleITK для регистрации изображений. Для моего текущего проекта мне нужно зарегистрировать рентгеновское изображение и КТ-изображение, а затем применить обратную матрицу к маске области интереса, трассируемой на...
1067 просмотров
schedule
16.10.2022
SimpleITK: как переводить маску в соответствии с исходной точкой, интервалом, направлением по умолчанию
Я работаю над проектом по сегментации медицинских изображений, и у меня проблемы с выравниванием масок и поражений. Я пытаюсь использовать пакет SimpleITK для исправления файлов масок ( .nrrd ) на основе их метаданных. Я предполагаю, что все...
678 просмотров
schedule
12.12.2022
SimpleITK Вращение объемных данных (например, МРТ)
У меня есть изображение размером 32x32x3 (высота, ширина, глубина), которое я пытаюсь повернуть вокруг оси z на 45 градусов в ситке. Однако похоже, что ось z / глубина, вокруг которой я вращаю ситк, находится под углом. Как я могу повернуть...
2442 просмотров
schedule
20.03.2023
Почему я не могу включить SimpleITK.h не может быть включен в C++ после установки?
Я установил SimpleITK и успешно протестировал ctest . Затем я включил библиотеку в .bashrc как export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:~/softwares/vtk-itk/SimpleITK-build/lib . Для установки я запустил make install в...
110 просмотров
schedule
21.07.2022
Как использовать SimpleITK LabelOverlapMeasuresImageFilter для извлечения мер на Python с помощью NiftiImages
Мне нужно извлечь набор метрик из двух помеченных 3D-изображений с одинаковыми размерами и типами данных ВСЕ ОДИНАКОВО , за исключением того, что один — мой серебряный стандарт, а другой — результат конвейера. .
мой код:
reader =...
350 просмотров
schedule
16.05.2023
Как поймать предупреждения SimpleITK?
Я загружаю том из папки dicom
import SimpleITK as sitk
reader = sitk.ImageSeriesReader()
dicom_names = reader.GetGDCMSeriesFileNames(input_dir)
reader.SetFileNames(dicom_names)
image = reader.Execute()
, и я получаю следующее предупреждение....
261 просмотров
schedule
11.03.2022
Как работать с отрицательными значениями пикселей в изображениях, загруженных с помощью simpleITK
Я работал с изображениями сканирования DICOM CT. Я использовал simleITK для чтения изображений в массив numpy. Но значения пикселей изображения являются отрицательными значениями с плавающей запятой, как показано на изображении, а dtype каждого...
79 просмотров
schedule
22.07.2023
Не удается установить библиотеку SimpleITK
Я устанавливаю с помощью следующей команды:
'python -m pip install SimpleITK'
Я получил ошибку во время CMake. Сообщение об ошибке приведено ниже: CMake Error at /usr/share/cmake-3.10/Modules/ExternalData.cmake:1121 (сообщение): Object...
15 просмотров
schedule
21.07.2022