Следующие файлы представляют собой два сопряжения файла fastq с парным концом, я хочу разделить каждый файл fastq в зависимости от их длины. mate1.fq : @SRR127.1...

Если я дам команду для AVGQUAL:20 без скользящего окна, будут ли установлены какие-либо значения по умолчанию для скользящего окна?

У меня есть текстовый файл, который представляет собой преобразованный файл fasta, в котором есть только конкретная область, которую мне интересно проанализировать. Это выглядит так CTGGCCGCGCTGACTCCTCTCGCT CTCGCAGCACTGACTCCTCTTGCG...

У меня есть пара файлов чтения с парным концом Illumina (например, A_1.fastq.gz и A_2.fastq.gz), созданных из одного бактериального изолята для вызова вариантов. Прежде всего, я использовал FLASH , чтобы объединить перекрывающиеся чтения из-за длины...