Вопросы по теме 'rstan'
Как получить стандартные ошибки оценок максимального правдоподобия в STAN?
Я использую оптимизацию максимального правдоподобия в Stan, но, к сожалению, функция optimizing() не сообщает о стандартных ошибках:
> MLb4c <- optimizing(get_stanmodel(fitb4c), data = win.data, init = inits)
STAN OPTIMIZATION COMMAND...
3817 просмотров
schedule
01.07.2023
Код Rstan для простой многомерной линейной модели
Я пытаюсь использовать Rstan, чтобы соответствовать модели из примеров Байесовских идей и анализа данных Кристенсена, Джонсона, Бранскума и Хэнсона: Введение для ученых и статистиков. Авторы используют WinBUGS, поэтому необходима некоторая адаптация....
2988 просмотров
schedule
23.06.2022
Модели смесей в Stan - векторизация
Сейчас я изучаю Стэна и хотел реализовать простую модель смеси.
В справочнике (stan-reference-2.14.0) уже есть решение:
data {
int<lower=1> K; // number of mixture components
int<lower=1> N; // number of data points
real y[N];...
1252 просмотров
schedule
05.05.2022
Указание целочисленной скрытой переменной в stan
Я изучаю байесовский анализ данных. Я пытаюсь воспроизвести учебные пособия от Trond Reitan от stan, которые изначально были созданы WinBugs.
В частности, у меня есть следующие данные и модель
weta.windata<-list(numdet=c(0, 0, 1, 0, 0, 0,...
1626 просмотров
schedule
19.01.2023
Полиномиальный логит с использованием rstanarm
Я знаю, что вы можете подобрать биномиальную логит-модель с пакетом rstanarm , используя stan_glm и установив family = binomial(link="logit") , но дает ли rstanarm возможность подобрать полиномиальную логит-модель?
Я нашел это...
1239 просмотров
schedule
04.10.2022
Интервальная оценка среднего будущих предсказанных значений
У меня есть байесовский код для оценки модели (немного сложной модели) в RStan. После оценки модели я взял 500 образцов наборов параметров из апостериорного распределения для моделирования данных модели на будущее (следующий 1 месяц). Наконец, я...
70 просмотров
schedule
02.04.2024
Не удалось установить пакеты R: x86_64-apple-darwin13.4.0-ar: нет такого файла или каталога — что такое ar?
Я получаю эту ошибку при установке пакетов R, таких как RStan (и все, что от него зависит, например, brms) и Devtools. Поскольку в сообщении, отображаемом во время установки, все, что было до этого, выглядит нормально, я думаю, что сбой установки...
2162 просмотров
schedule
06.01.2023
Как использовать stan в rmarkdown
Я хотел бы получить оценочные коэффициенты модели, используя rstan в rnotebook
У меня есть следующий блок stan :
```{stan output.var="rats"}
data {
int<lower=0> N;
int<lower=0> T;
real x[T];
real y[N,T];
real xbar;
}...
2744 просмотров
schedule
22.05.2022
Проблемный `rstanarm::stan_lmer` - недопустимое внутреннее подмножество
Я столкнулся со следующей проблемой, которая, по-видимому, связана с подмножеством, выполненным в rstanarm . См. эту связанную проблему
Ошибка в xj[i]: неверный тип индекса 'список'
воспроизводимый пример:
library(stringi)...
86 просмотров
schedule
20.08.2022
Реализация экспоненциальной общей линейной модели в Stan / RStan
У меня такая модель:
Я хочу узнать, как реализовать эту модель.
Исследование и попытка
В качестве примера я видел следующий пуассоновский GLM:
```{stan output.var="PoissonGLMQR"}
data{
int<lower=1> n;...
618 просмотров
schedule
08.05.2022
Как rstan хранит апостериорные образцы для отдельных цепочек?
Я хотел бы понять, как вывод extract в rstan упорядочивает апостериорные образцы. Я понимаю, что могу просмотреть апостериорные образцы из каждой цепочки, используя as.array ,
stanfit <- sampling(
model,
data = stan.data)
fitarray...
281 просмотров
schedule
05.02.2024
Заказанная оценка пробита в стандарте
Я пытаюсь воспроизвести упорядоченную пробит-модель JAGS из книги Джона Крушке «Проведение байесовского анализа» (стр. 676) в Стэне:
Модель JAGS:
model {
for ( i in 1:Ntotal ) {
y[i] ~ dcat( pr[i,1:nYlevels] )
pr[i,1] <-...
156 просмотров
schedule
26.12.2022
rstan() не должен запускаться в #'@example?
При разработке пакетов для каждого примера требуется ‹5s. Однако пара stan_model() и rstan::sampling() занимает больше времени, чем 5 с, следующим образом:
Examples with CPU or elapsed time > 5s
user system...
81 просмотров
schedule
16.07.2022
Задание априорного распределения на матрице в rstan
У меня возникли проблемы с получением байесовской модели смешанных эффектов для получения стационарных и хорошо перемешанных цепочек. Я создал свои собственные данные, поэтому знаю, какие параметры должна извлекать модель. К сожалению, из-за того,...
283 просмотров
schedule
25.02.2022
Использование разных априорных значений для групп независимых переменных в модели байесовской пробит-регрессии (rstanarm)
Я использую байесовскую логистическую регрессию (пробит) из пакета rstanarm для обучения модели событиям по умолчанию. В качестве входных данных модель принимает некоторые финансовые коэффициенты и некоторые качественные данные. Есть ли способ,...
73 просмотров
schedule
07.08.2023
Вам нужен Xcode для запуска пакетов rstan или brms в RStudio MacOS?
Вам нужен Xcode для запуска пакетов rstan и / или brms в RStudio MacOS?
Мне пришлось установить Xcode, чтобы получить пакеты rstan или brms на RStudio MacOS. Нужно ли мне держать Xcode на моем жестком диске, чтобы пакеты работали? Я не хочу...
108 просмотров
schedule
12.07.2022