Я знаю, что это распространенная ошибка, и я уже проверял другие сообщения, но это не решило мою проблему. Я хотел бы использовать имя базы данных, которую я использую для правила SortMeRNA ( rRNAdb=config["rRNA_database"] ), так же, как я...

У меня есть кадр данных, состоящий из sample_id в именах столбцов, имен генов в именах строк и матрицы значений (rnaseq tpm). Я хочу выполнить pca() из пакета M3C. Я сначала log2 преобразовал свою матрицу, используя: df_log2 <- mutate_if(df,...

Как можно извлечь гены/наблюдения из групп строк, сгенерированных из cutree_rows = 3 в pheatmap ? будет obj$tree_row$... ? obj <- pheatmap(mat, annotation_col = anno, fontsize_row = 10, show_colnames = F, show_rownames = F, cutree_cols = 3,...