Вопросы по теме 'reproducible-research'

автоматизированный текст для воспроизводимых исследований
Я использую RStudio, R Markdown, Latex и Pandoc для очистки данных, построения переменных, запуска анализа и отчета о результатах. Я новичок в концепции воспроизводимых исследований, но я зацепился. Имеет большой смысл. Динамические таблицы и...
253 просмотров
schedule 10.06.2022

Воспроизводимое исследование: преобразование файлов данных sas7bdat в файлы csv путем вызова statTransfer с помощью GNU make
ВОПРОС: Я новичок в GNU Make. Есть ли лучший способ программно преобразовать наборы статистических данных из sas7bdat в файлы csv и синхронизировать их друг с другом с помощью GNU Make для содействия воспроизводимым исследованиям? Подойдете ли вы...
1498 просмотров
schedule 26.06.2023

Knitr — опция кеша движка Python не работает
yihui приводит пример использования опции кеша для разных движков https://github.com/yihui/knitr-examples/blob/master/023-engine-python.Rmd Я не могу заставить его работать на python. Следующие работы ```{r,engine='python',cache=TRUE}...
714 просмотров
schedule 31.07.2023

Как использовать Hmisc::latex()
Hmisc::latex(), кажется, игнорирует все аргументы, которые я ему даю, кроме object . Трудно указать на конкретный вопрос, на который мне нужно ответить, кроме -- "Как я могу заставить Hmisc::latex()" распознавать аргументы, о которых говорится в его...
1082 просмотров
schedule 16.05.2022

NameError: имя «session_conf» не определено при попытке получить воспроизводимые результаты в google colab
Я пытаюсь получить воспроизводимые результаты в Google Colab, используя следующий код. Но я получаю сообщение об ошибке «NameError: имя« session_conf »не определено». import numpy as np import tensorflow as tf import random as rn import os...
714 просмотров

Как создать исполняемый исследовательский сборник (erc)?
У меня есть рукопись для научной публикации, данные и сценарии, использованные для создания результирующих рисунков и таблиц. Как я могу заключить эти три в исполняемый исследовательский сборник, чтобы другие могли легко воспроизвести вычислительные...
46 просмотров
schedule 30.06.2022

Как я могу всегда получать мой последний образ докера, но при этом детерминировано записывать его состав для будущей воспроизводимости?
Я выполняю аналитическую работу в среде докеров «Лаборатория», которой я управляю. Я использую Travis для сборки, тегирования и публикации лабораторного образа в реестре контейнеров докеров (AWS ECR), а затем всегда извлекаю образ latest , когда...
585 просмотров

Как обеспечить повторяемость кода Julia и связанных зависимостей?
Скажем, у меня есть проект, в котором я выполняю анализ (т. Е. Не хочу разрабатывать совместно используемый пакет), но я хочу убедиться, что другие могут клонировать репозиторий и создать экземпляры зависимостей и запустить код, как написано. Шаги,...
58 просмотров