В источнике данных PubMed мне нужно поместить вывод в очередь Kafka. Каждый источник можно рассматривать как тему Kafka. (Я знаю концепции Кафки и исследовал Кафку с помощью Python) Я могу просматривать данные PubMed через FireFTP. Может ли...

Мне нужно автоматизировать сбор статей PubMed. Я нашел только примеры загрузки статей PubMed по запросу термина и загрузки статьи PubMed по пмид . (ОДНА СТАТЬЯ) Но я думаю о том, чтобы загрузить СПИСОК идентификаторов PubMed по дате (от-до) или все...

Я пытаюсь ввести более 200 записей в pubmed, чтобы записать количество статей, опубликованных автором, и уточнить поиск, включив его/ее наставника и учреждение. Я пытался сделать это с помощью biopython и xlrd (код ниже), но постоянно получаю 0...

Я извлекаю данные из PubMed как XML и использую curl для обработки этих результатов, которые я загружаю на другую страницу как SimpleXML. Это позволяет мне получить необходимую мне информацию (список идентификаторов пабов) и использовать ее в...

В python 3.5 для загрузки некоторых статей из pubmed на основе их DOI я использовал эту ссылку на github https://github.com/antiufo/scihub.py прежде всего я установил все пакеты и скопировал этот класс...

Я использую пакет RISmed в R для получения информации из PubMed. Функция пакета «Mesh» позволяет мне получать термины MeSH для каждой цитаты. Тем не менее, это список, содержащий фрейм данных. Я хочу перечислить каждый термин MeSH помимо его...

Я пытаюсь декодировать вывод pubmed json следующим образом. https://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/eutils/esummary.fcgi?db=pubmed&id=29753496&retmode=json...

abstract.txt = "The insulin-like growth factor 1 (IGF1) signaling pathway has emerged as a major регулятор процесса старения, от грызунов до человека. Однако, учитывая плейотропное действие IGF1, его роль в старении мозга остается сложной и...

Я использовал чрезвычайно полезный пакет rentrez в R для получения информации об авторе, идентификаторе статьи и принадлежности автора из базы данных Pubmed. Это отлично работает, но теперь я хотел бы извлечь информацию из поля принадлежности. К...