У меня есть фрейм данных из 2 столбцов; где первый столбец содержит данные в формате d/m/y h:m (за один год), а второй столбец содержит показания счетчика электроэнергии. Например: Date.Time X 13/12/2014 12:00 164 13/12/2014 12:30...

Итак, я пытаюсь создать красивую тепловую карту с функцией pheatmap в R. Я хочу иметь цветные полосы на месте остановки дендрограммы и начала графика, чтобы аннотировать различные кластеры. Как горизонтальная толстая линия, проходящая через...

У меня есть две матрицы в двух разных файлах csv, и я хочу построить их с одинаковой цветовой шкалой. Это то, что у меня есть сейчас, и это НЕ работает: Как видите, оба изображения используют одни и те же цветовые диапазоны (от синего до...

Я работаю с пакетом тепловой карты. По умолчанию он рисует график на экране. В моем случае это означает вывод в блокноте R markdown в R studio. Но я также хочу сохранить в файл. Если я сохраню его в файл с аргументом filename= , он не будет...

Я новичок в R и начал использовать pheatmap для визуализации двукратных изменений экспрессии генов в обработанных и контрольных клетках. По умолчанию pheatmap устанавливает верхний предел цветового ключа на 6 и нижний предел на -2. Есть ли способ...

Я изучаю R для анализа данных экспрессии генов. Я мог бы создать красивую тепловую карту, используя пакет pheatmap . Однако при переходе между блоками разного цвета он автоматически вводит цвет границы, который я вижу после увеличения. Это...

Я создал тепловую карту, используя приведенный ниже код: library(pheatmap) library(dplyr) data = data.frame(matrix(runif(10*10), ncol=10)) data$sample = rep(c("tumour", "normal"), 5) data$subject.ID = paste('Subject', 1:10) data = data %>%...

Как я могу изменить цвет текста в pheatmap? Я пробовал следующее, но это не меняет текст и метки осей, но это не работает par( col.lab="#FFFFFF", fg="#FFFFFF", col.main="#FFFFFF", col.axis="#FFFFFF", cex.main=2, cex=2) pheatmap(heat_data,...

Я работал с фреймом данных Log2, который выглядит так: library(dplyr) str(df[1:10]) $ 5W_Female_C#1_1 : num 0 0 0 0 0 ... $ 5W_Female_C#1_2 : num 2.28 0 0 0 0 ... $ 5W_Female_C#1_3 : num 0 0 0 0 0 ... $ 5W_Female_C#1_4 :...

Я делаю тепловую карту, используя пакет pheatmap в R. По умолчанию названия строк отображаются в правой части тепловой карты. Кто-нибудь знает, как их переместить в левую часть? В некоторых других пакетах есть функции для этого, например...

Я пытаюсь раскрасить произвольные ячейки ячеек на диаграмме, созданной с помощью пакета R pheatmap . Краткий пример: library (pheatmap) dat <- as.data.frame (scale (mtcars)) pheatmap (dat, color = colorRampPalette (c...

Тестовые RData : https://www.dropbox.com/s/hy56owg4mfjuxol/Test_Data.RData?dl=0 CSV : https://www.dropbox.com/s/hs6qpoxyg54ehid/Test_Data.csv?dl=0 Аннотации: https://www.dropbox.com/s/akv66euwh3ulia2/Test_Data_Annotation?dl=0...

Я использую одни и те же варианты кода тепловой карты для создания тепловых карт уже несколько месяцев без каких-либо проблем, но в последнее время он перестал кластеризовать строки. Столбцы по-прежнему группируются, как обычно, но всякий раз, когда...

Как можно извлечь гены/наблюдения из групп строк, сгенерированных из cutree_rows = 3 в pheatmap ? будет obj$tree_row$... ? obj <- pheatmap(mat, annotation_col = anno, fontsize_row = 10, show_colnames = F, show_rownames = F, cutree_cols = 3,...