Я запускаю конвейер Nextflow, который запускает каждый процесс в другом контейнере Docker. Я запускаю этот конвейер внутри виртуальной машины. Хотя некоторые процессы работают нормально, в одном из них выдает ошибку:...

У меня проблема со скриптом Python в Nextflow, моя цель - написать файл в скрипте python, взять его с помощью nextflow и сохранить файл в publishdir (и после того, как я использую этот файл в другом процессе). Мой процесс в nextflow выглядит примерно...

Я пытаюсь запустить процесс, только если выполняется комбинация условий, но при проверке того, есть ли у канала путь к файлу, он всегда возвращает его как пустой. Возможно, я что-то делаю не так, в таком случае исправьте мой код. Я попытался...

Я только что создал новую среду для nextflow, но когда я запускаю скрипт, шаги процесса расширяются следующим образом: [warm up] executor > local [9c/f50613] Submitted process > bowtie2_target_genome (2) [1f/1b1f43] Submitted process >...

Я изо всех сил пытаюсь использовать if / else в инструкции containsAll() . Он возвращает правильное значение true false при тестировании с println() , но когда помещается в оператор if , кажется, что он всегда оценивается как истина - см....