Я пытаюсь построить график, который отображает метки только для определенных вершин. В этом случае я хочу отображать метки только для вершин с определенным количеством ребер. Я читаю вершины и ребра графического объекта следующим образом:...

Опираясь на здесь этот вопрос , есть ли способ расширить этот подграф, чтобы включить вершины, соединенные двумя степенями с подмножеством вершин? Я думаю о команде, похожей на функции в make_ego_graph(), где order=2 и mode="in". Я работаю с...

Я пытаюсь выполнить сетевой анализ в igraph, но у меня есть некоторые проблемы с преобразованием набора данных, который у меня есть, в список краев (с весами), учитывая разное количество столбцов. Набор данных выглядит следующим образом (конечно,...

Я могу рассчитать некоторые метрики центральности сети, такие как центральность по степени и центральность по близости, используя Cytoscape.js, но я не видел встроенной функции для вычисления центральность собственного вектора (собственная...

Из своего набора данных я пытаюсь составить пары на основе рейтинга. мои данные выглядят так ID grp rank 1 grp1 1 1 grp2 1 1 grp3 2 2 grp1 1 2 grp2 2 2 grp2 2 2 grp2...

Когда я использую цикл for от R для одновременного преобразования многих элементов (каждый из которых является матрицей) в списке в igraph объектов с помощью функции «graph.incidence», код ниже используется и выполняется: storage2 <- list()...

У меня есть взвешенный список ребер, и я хочу преобразовать его в матрицу смежности. Есть ли простой код, который я могу использовать для этого? Данные выглядят так: From To Weight 1 a a 0.3274570 2 b a 0.7188648 3 a b...

Я заинтересован в использовании Cytoscape для анализа молекулярных отношений между генами, и я читал руководства на веб-сайте Cytoscape, но не уверен, как использовать Cytoscape для сравнений «один-ко-многим». Например, каждый ген обычно...

Я искал ответы на этот вопрос и нашел похожие ( Подсчитать количество строк внутри каждой группы , подсчитывать уникальные комбинации значений переменных в столбце кадра данных R , R подсчитывает количество вхождений элемента по группам ), но ни...

У меня есть следующие данные: Name Line Manager A1 B1 A2 B1 A3 B2 B1 C1 B2 C1 A4 C1 Я хочу преобразовать данные следующими двумя способами. После преобразования я смог найти...