Вопросы по теме 'imagej'

выполнить строку как код в ImageJ (java)
Код находится в строке, пример: String str = "IJ.run(\"FJ Edges\", \"\");"; Если выполняется str, будет запущено соответствующее содержимое.
557 просмотров
schedule 23.05.2022

Получить координаты x и y в переменные в макросе ImageJ
Я хочу иметь возможность разместить точку на изображении с помощью инструмента выбора точки, а затем прочитать координаты x и y в переменную в макросе. Я пробовал getSelectionCoordinates, но это не работает. Я не хочу отображать координаты в...
5536 просмотров
schedule 29.04.2022

Java – как добавить слушателя в плагин ImageJ?
Я пишу плагин для ImageJ, который сканирует пиксели нужной строки на яркость по серии кадров в видео AVI. Данные отображаются в виде 2D-графика для активного видеокадра, пикселей по оси X и интенсивности по оси Y. Я хочу, чтобы график обновлялся,...
543 просмотров
schedule 27.06.2022

Научная обработка изображений (в ImageJ) — советы по удалению фона
У меня есть куча фильмов о расщеплении бактерий, и я должен отследить их, обнаружить расщепление и так далее. Теперь, я новичок в этой области, поэтому я ищу первоначальные советы о том, как действовать. Я приложил несколько скриншотов . Для...
2039 просмотров

Ошибка импорта в imagej. импортировать утилиту.Сервис?
Я пытаюсь запустить этот алгоритм обнаружения CannyEdge на ImageJ. Код находится здесь по ссылке, указанной. Проблема в том, что он не может импортировать утилиту. Сервис, как указано в файле. Я не могу найти такой плагин. Пожалуйста помоги....
74 просмотров
schedule 19.05.2023

Как читать пользовательские данные PNG с помощью ImageJ?
Я только начинаю с ImageJ, и мне было интересно, знает ли кто-нибудь способ чтения пользовательских данных, которые могут быть сохранены в файле PNG. Причина этого в том, что с помощью LabView я создаю 16-битный PNG-файл в градациях серого, в котором...
514 просмотров
schedule 12.04.2023

ImageJ API: использование фильтра в моем собственном коде
Я хотел бы отфильтровать изображение с помощью API ImageJ. Библиотека ImageJ правильно подключена к моему проекту. Теперь я хочу обработать изображение средним фильтром из API. Как это работает? public Image filterMyImage(ImagePlus imagePlus)...
881 просмотров
schedule 27.04.2022

ImageJ API: объединение изображений
Используя API ImageJ, я пытаюсь сохранить составное изображение, состоящее из нескольких изображений, расположенных рядом. У меня есть код, который загружает объекты ImagePlus и сохраняет их. Но я не могу понять, как вставить изображение в другое...
2267 просмотров
schedule 23.10.2022

Как отключить автоматическую настройку яркости/контрастности при создании стопки изображений
У меня есть большое количество изображений, которые образуют временные ряды, но они значительно различаются по яркости и контрасту. Очень легко настроить яркость/контрастность для каждого изображения, однако, когда я создаю ImageStack с несколькими...
1419 просмотров
schedule 02.06.2022

Автоматическая перезапись ImageJ при использовании saveAs
В настоящее время я использую ij.jar в приложении Java и использую ImageJ для сохранения некоторых обработанных изображений на диск. Однако, если я попытаюсь сохранить изображение в уже существующий файл, сохранение завершится неудачно. Исходный...
1244 просмотров
schedule 04.01.2023

Параметры преобразования 16-битного изображения
когда я открываю 16-битное изображение в формате tiff, оно открывается как черное изображение. 16-битное изображение в формате TIFF открывается только в программе ImageJ; однако он не открывается в предварительном просмотре. Мне интересно, какие у...
15346 просмотров
schedule 18.01.2024

ImageJ — рисование стрелок, соединяющих центроиды двух изображений с помощью плагина
Итак, я делаю небольшой проект для своей работы, где мне нужно взять два изображения, одно из ядер и одно из телец Гольджи, и соединить их стрелками с двумя центроидами в качестве конечных точек. Я уже некоторое время ломаю голову, и вот исходник на...
937 просмотров
schedule 04.09.2022

pixFRET — запуск плагина для таймлапс-изображений // зацикливание?
Я только недавно начал работать с ImageJ (и, следовательно, у меня нет большого опыта в программировании макросов), чтобы анализировать мои микроскопические изображения. Для создания попиксельных изображений FRET, скорректированных на спектральное...
765 просмотров
schedule 27.09.2022

ImageJ: Слушатель в инструменте выбора точки
Я хочу настроить собственную программу, используя ImageJ в качестве библиотеки. Так что это не будет плагином. Пользователь может открыть изображение, а затем отметить точку с помощью инструмента выбора точки, предоставленного ImageJ. Когда...
586 просмотров
schedule 11.03.2023

открытие необработанного файла с помощью imagej в командной строке
Я пытаюсь создать файл .bat для чтения файлов .bsv и превращения их в цветные png. Первая часть этого заключается в использовании imagej для открытия .bsv, а затем с использованием плагина «сохранить все», который я добавил. Я пытался сделать...
4383 просмотров

Макрос Imagej для сохранения данных, сгенерированных результатами, и страниц журнала в один и тот же конечный файл Excel.
Я создал макрос, который генерирует результаты как в журнале, так и на страницах результатов. Мне нужен макрос, который сохраняет как результаты, так и файлы журнала в один большой файл Excel и организован по имени изображения....
6963 просмотров
schedule 17.07.2023

Каждая частица ROI Analyze в отдельном выходном файле; ИзображениеJ
Привет всем из Словении! Моя проблема: я запускаю анализ частиц в разных областях интереса, используя следующий макрос: id = getImageID(); for (i=0 ; i<roiManager("count"); i++) { selectImage(id); roiManager("select", i);...
1128 просмотров
schedule 19.07.2022

Как эффективно изменить мои ROI
Я работаю над программой, которая будет использоваться для моих исследовательских нужд. Остался последний шаг, который я не могу решить самостоятельно. На изображении вы можете увидеть две ROI, которые были выбраны на основе ссылки макроса:...
244 просмотров
schedule 31.08.2022

ImageJ: растяжка гистограммы против выравнивания
Я работаю над проектом, в котором мне нужно отобразить некоторые изображения (оттенки серого), и я заметил, что многие из них были слишком темными, чтобы их можно было правильно увидеть. Затем, просмотрев документацию API ImageJ, я нашел класс:...
1670 просмотров
schedule 13.10.2022

Как анимировать окно стека ImageJ
Я пытаюсь анимировать окно стека ImageJ с помощью следующего кода, который находится в моем классе customGUI: ImageCanvas ic = new ImageCanvas(image); StackWindow sw = new StackWindow(image,ic); panel2.add(sw.getContentPane());...
94 просмотров
schedule 06.08.2023