Публикации по теме 'gsoc-2019'
Путешествие по GSoC, часть 3. Анализ данных
Выбор функций и обучение модели
Пожалуйста, ознакомьтесь с Частью 1 и 2 серии GSoC, если вы еще этого не сделали. Весь код можно найти здесь .
Теперь, когда мы собрали данные как из Ensembl, так и из RefSeq, пришло время сгенерировать функции, которые будут входным слоем для наших моделей машинного обучения.
А) Генерация признаков
Всего мы создали 12 и более фич, здесь я расскажу о самых важных —
Функция перекрытия: перекрывающийся ген — это ген , экспрессируемая..
Путешествие по GSoC, часть 4. Заключительный отчет и резюме
Подробное описание работы смотрите в Часть 1 , 2 и 3 .
Найдите весь мой код здесь .
Ученик: Шриджан Верма ( vermasrijan )
Организация: гены, геномы и вариации ( ансамбл )
Наставник: Даниэль Зербино
Какая работа была проделана?
Данные, собранные из Ensembl. → Использовались RESTful API для получения числовых данных. → Для получения данных последовательности использовались файлы gff3 и fasta. Данные собраны из RefSeq → Для этого использовались файлы gff3 и fasta...