Вопросы по теме 'ggtree'

Можно ли закодировать geom_text в gg_tree, чтобы расстояние от узлов не менялось?
Я выровнял некоторые аминокислотные последовательности в R и импортировал матрицу расстояний (dist_mat) для использования в ggtree, используя tree <- ape::nj(dist_mat) . Это выглядит примерно так: node parent branch.length x...
221 просмотров
schedule 13.06.2022

Как раскрасить кончики дерева по группе в ggtree?
Как мне просто раскрасить кончики моего дерева в соответствии с группой, к которой принадлежит образец? nwk <- system.file("extdata", "sample.nwk", package="treeio") tree <- read.tree(nwk) group_1 <-...
51 просмотров
schedule 20.02.2022

Как я могу нанести цветные метки подсказок в ggtree, не включая их в легенду?
Я пытался построить дерево с цветными ветвями и подсказками, используя пакет ggtree в R. Вот пример кода, использующего дерево ящериц Anolis . library(ggtree);library(tidyverse);library(ape)...
123 просмотров
schedule 27.03.2023