Вопросы по теме 'ggtree'
Можно ли закодировать geom_text в gg_tree, чтобы расстояние от узлов не менялось?
Я выровнял некоторые аминокислотные последовательности в R и импортировал матрицу расстояний (dist_mat) для использования в ggtree, используя tree <- ape::nj(dist_mat) . Это выглядит примерно так:
node parent branch.length x...
221 просмотров
schedule
13.06.2022
Как раскрасить кончики дерева по группе в ggtree?
Как мне просто раскрасить кончики моего дерева в соответствии с группой, к которой принадлежит образец?
nwk <- system.file("extdata", "sample.nwk", package="treeio")
tree <- read.tree(nwk)
group_1 <-...
51 просмотров
schedule
20.02.2022
Как я могу нанести цветные метки подсказок в ggtree, не включая их в легенду?
Я пытался построить дерево с цветными ветвями и подсказками, используя пакет ggtree в R. Вот пример кода, использующего дерево ящериц Anolis .
library(ggtree);library(tidyverse);library(ape)...
123 просмотров
schedule
27.03.2023