Вопросы по теме 'dendextend'

Как пометить конечные узлы разрезанной дендрограммы?
Я использовал следующий код, чтобы вырезать дендрограмму на определенной высоте. Проблема, с которой я столкнулся, заключается в том, что когда я вырезаю дендрограмму, я не могу понять, как добавить метки к узлам. Как я могу вырезать дендрограмму с...
2839 просмотров
r hierarchical-clustering dendrogram dendextend
schedule 17.11.2022
Как получить доступ к атрибутам дендрограммы в R
Из дендрограммы, которую я создал с помощью hc<-hclust(kk) hcd<-as.dendrogram(hc) я выбрал подветку k=hcd[[2]][[2]][[2]][[2]][[2]][[2]][[2]][1] Когда у меня просто отображается k, это дает: > k [[1]] [[1]][[1]] [1] 243...
965 просмотров
r attributes dendrogram dendextend
schedule 11.09.2022
hclust () с cutreehow для построения кластера cutree () в одном hclust ()
Я кластерный мой hclust () дерево на несколько групп с cutree (). Теперь я хочу функцию hclust () в несколько groupmembers как hclust () ... ТАКЖЕ: Я разрезал одно дерево в 168 групп, и я хочу 168 hclust () деревья ... Мои данные 1600 * 1600...
11687 просмотров
r hclust dendextend
schedule 08.06.2024
Модификация дендрограммы с использованием dendextend в R
Я пытаюсь изменить и настроить дендрограмму кластера с помощью dendextend, используя следующие коды: # prepare hierarchical cluster hc = hclust(dist(mtcars)) dend <- as.dendrogram(hc) dend %>% set("branches_lty", 3) %>% plot()...
202 просмотров
r dendrogram dendextend
schedule 19.06.2022
Получение иерархии кластеров и назначений вложенных кластеров
В настоящее время я изучаю иерархию в темах документов. В качестве первого шага я нахожу векторное представление своих документов, после чего использую иерархическую кластеризацию, чтобы определить, есть ли темы в темах документа. Я хочу...
757 просмотров
r hierarchical-clustering hclust dendrogram dendextend
schedule 05.04.2022
Дендрограмма в R: как правильно развесить ветки (после раскраски меток)?
Я рассмотрел другие вопросы, заданные по этой теме, и мне удалось «частично» получить то, что мне нужно. Я хочу, чтобы листья моей дендрограммы были закодированы цветом. Каждый отпуск представляет собой рынок, и у меня есть еще один столбец в моем...
392 просмотров
r colors dendrogram dendextend
schedule 15.07.2022
Как раскрасить ветви в R-дендограмме в зависимости от классов в ней?
Я хочу визуализировать, насколько хорошо работает алгоритм кластеризации (с определенной метрикой расстояния). У меня есть образцы и соответствующие им классы. Чтобы визуализировать, я группирую и хочу раскрасить ветви дендрограммы элементами в...
1214 просмотров
r classification hierarchical-clustering dendrogram dendextend
schedule 30.11.2022
R: Цвет ветвей дендрограммы с сохранением цветовой легенды.
Цель: создать дендрограмму с ветвями, окрашенными факторной переменной, с полученным графиком, содержащим легенду для преобразования цветов ветвей в каждое значение факторной переменной. У меня есть данные с факторными переменными, за которыми...
1092 просмотров
r data-visualization dendrogram ggdendro dendextend
schedule 27.04.2022
R получение поддеревьев из дендрограммы на основе меток разрезов
Я сгруппировал большой набор данных и нашел 6 кластеров, которые мне интересно проанализировать более подробно. Я нашел кластеры, используя hclust с методом "ward.D", и хотел бы знать, есть ли способ получить "поддеревья" из объектов hclust /...
4856 просмотров
r hclust dendextend
schedule 04.07.2022
Как раскрасить метки дендограммы с помощью dendextend и heatmap.2 с использованием предварительно определенных групп образцов
heatmap.2 назначает меткам неправильные цвета при использовании аргумента colRow. Есть ли альтернативный способ присвоения цвета меткам на тепловой карте.2? Или я что-то не так делаю? (примеры основаны на примерах из метки и дендрограммы цветных...
494 просмотров
r colors gplots dendrogram dendextend
schedule 28.09.2023
Сохранение цвета метки и легенды на двух дендрограммах
Цель: я хотел бы сохранить цвет метки и цвет легенды на двух дендограммах, созданных для одного и того же набора данных. У меня есть тот же набор данных (40 наблюдений), который преобразуется в дендограмму в 2 процесса (предварительно...
38 просмотров
r ggdendro dendextend
schedule 29.10.2022
Метки кластеров обрезаны на горизонтальной дендрограмме hclust.
Я использовал hclust и as.dendogram для создания дендрограммы, но когда я поворачиваю ее в горизонтальное положение, названия моделей обрезаются. Как я могу убедиться, что на графике отображаются все названия моделей?
1312 просмотров
r hclust dendrogram dendextend
schedule 14.07.2022
Добавление строк таблицы к меткам дендрограммы
По сути, я пытаюсь изменить метки моей дендрограммы на соответствующую строку в таблице. Например, рассмотрим набор данных USArrest. Прямо сейчас метки на дендрограмме — это просто названия штатов, «Алабама» и так далее. Но глядя на таблицу...
56 просмотров
r hclust dendrogram dendextend
schedule 12.10.2022
Как измерить сходство между двумя деревьями кластеризации, полученными в результате иерархической кластеризации?
Я хочу применить метод иерархической кластеризации (т. е. агломеративную кластеризацию) к разным наборам данных. Я хотел бы сравнить полученные деревья кластеризации. Есть ли какое-нибудь решение для этого? Заранее спасибо.
236 просмотров
correlation hierarchical-clustering similarity dendrogram dendextend
schedule 03.07.2022
Как я могу создать большую танглограмму в R, которую можно прочитать и сохранить
Я использую cophyloplot для создания tanglegram из двух филогенетических деревьев. Этот метод хорошо работает с маленькими деревьями, но по мере того, как деревья становятся больше, выходное изображение остается того же размера, и я не могу найти...
245 просмотров
r dendrogram phylogeny dendextend
schedule 14.05.2022
Добавить метки в дендрограмму в R
Я пытаюсь применить иерархическую кластеризацию для временных рядов, чтобы определить состояния с похожим поведением во временном ряду для резидентных_процентов_изменений_из_базовых. Я получаю дендрограмму, но индекс, который я получаю по оси X, —...
35 просмотров
r time-series hierarchical-clustering dendrogram dendextend
schedule 13.06.2022