Вопросы по теме 'cox-regression'

Вывод регрессии Кокса в xtable - выбор строк / столбцов и добавление доверительного интервала
Я не хочу экспортировать результат регрессии Кокса в таблицу, которую затем могу поместить в свою статью. Я думаю, лучший способ сделать это с помощью xtable: library(survival) data(pbc) fit.pbc <- coxph(Surv(time, status==2) ~ age + edema +...
5631 просмотров
schedule 12.07.2023

Определение структуры дисперсии в модели Кокса со смешанными эффектами в R
Я устанавливаю модель Кокса со смешанными эффектами в R, используя функцию coxme() в пакете coxme. В моей модели у меня есть цензурированное время выживания $ X $, единственная ковариата $ Z $ и группирующая переменная $ Group $. Есть случайный...
1070 просмотров
schedule 02.01.2023

Как я могу получить вывод кумулятивного коэффициента опасности от coxph?
Как я могу получить вывод кумулятивного коэффициента опасности от coxph? У меня есть моя модель coxfit <- coxph(Surv(combi$survival, combi$realdeath) ~ combi$meanrr, combi) и получить результат # Call: # coxph(formula =...
6252 просмотров
schedule 08.05.2024

Прокрутите список переменных, чтобы добавить их в базовую модель выживания, а затем сохраните ключевой вывод в таблице.
Вопрос, состоящий из двух частей: во-первых, у меня есть список из n переменных во фрейме данных, которые я хочу последовательно заменить в модели выживания (таким образом создав n новых моделей), и из вывода каждой я хочу сохранить только сводку...
1104 просмотров
schedule 22.02.2023

R изменение формы/расширение набора данных с использованием survSplit для получения переменной во времени для регрессии Кокса
Я видел другие вопросы, подобные этому, но они не отвечают на мой вопрос. Я хочу расширить свой набор данных, так как мне нужно создать изменяющуюся во времени переменную для анализа выживания и использовать команду survSplit (пакет survival ), но...
391 просмотров

Логический индекс Lifelines в Python не соответствует индексированному массиву по измерению 0; размер равен 88, но соответствующий логический размер равен 76
Этот очень простой фрагмент кода, # imports... from lifelines import CoxPHFitter import pandas as pd src_file = "Pred.csv" df = pd.read_csv(src_file, header=0, delimiter=',') df = df.drop(columns=['score']) cph = CoxPHFitter() cph.fit(df,...
870 просмотров
schedule 17.12.2022

Предел прогноза при нормальной регрессии и регрессии выживания
Я пытаюсь предсказать, через какое время протекут газовые трубы. Я использовал 15 признаков, самым важным из которых является «год установки трубы». Последние данные об утечке, которые у меня есть, относятся к утечке, которая произошла в 2017 году,...
35 просмотров

Ошибка при передаче аргумента веса функции coxph с использованием RiskRegression в R
Я пытаюсь использовать обратную вероятность взвешивания лечения в регрессии Кокса для конкретной причины, используя функцию CSC в пакете riskRegression . Я вычислил веса без проблем, но когда я пытаюсь передать веса функции CSC , я получаю...
117 просмотров
schedule 22.07.2022

Взаимодействия в модели пропорциональных рисков Кокса: проблема между контрастами и двумя категориальными факторами
Мне нужна помощь, чтобы понять, как работает функция coxph () в R, и как правильно интерпретировать вывод. Я пытаюсь запустить модель пропорциональных рисков Кокса на наборе данных «анализа выживаемости» с двумя факторами: полом и генотипом....
698 просмотров

p. фильтрация значений из функции lapply, примененной к функции coxph
Я провожу анализ выживаемости для каждого из уровней экспрессии 566 генов. Я сделал это, объединив функцию coxph() с функцией lapply , и это сработало. Прямо сейчас, из-за большого количества рассмотренных генов, я застрял в том, как выполнить...
53 просмотров
schedule 24.09.2022

Сеанс R прерван при использовании coxph для соответствия модели mstate
Я пытаюсь использовать пакет mstate и функцию coxph с помощью команды strata примерно для 10 000 наблюдений. Но каждый раз, когда я запускаю команду coxph, сеанс прерывается. Я действительно нуждаюсь в помощи. Вот код: tmat <- transMat(x =...
23 просмотров

Алгоритмы выбора признаков, используемые для фильтрации значимых однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) для заданного результата
Я немного новичок в анализе типов полногеномных ассоциаций (GWAS). В одном из моих проектов мне нужно выбрать наиболее значимые SNP (не семьи, а индивидуальные SNP) для заданной переменной результата (например: - Наличие сердечного приступа...
10 просмотров