Java JFilechooser

Как насчет сериализации объектов? Вы можете сохранить объект JFileChooser в файл, а затем извлечь его.

Сохраняйте ссылку на него и создавайте его только один раз. В последующих случаях он должен открываться так же, как и при удалении пользователем. Вам потребуется предпринять дополнительные шаги, чтобы восстановить местоположение средства выбора файлов.

Сохранение между прогонами.

Существует несколько способов хранения данных между запусками (например, файл свойств, XML, Preferences и т. д.). Это быстрый и грязный способ добиться этого.

import java.awt.event.*;
import javax.swing.*;
import java.io.*;

class SerializeMyChooser {

    static private JFileChooser fileChooser;
    static File serializedChooser = new File("chooser.ser");

    public static void main(String[] args) {
        SwingUtilities.invokeLater( new Runnable() {
            public void run() {
                final JButton showChooser = new JButton("Open File");
                showChooser.addActionListener( new ActionListener() {
                    public void actionPerformed(ActionEvent ae) {
                        if (fileChooser==null) {
                            if (serializedChooser.exists()) {
                                // use the resialized form
                                try {
                                    ObjectInputStream ois = new ObjectInputStream(
                                        new FileInputStream(serializedChooser));
                                    fileChooser = (JFileChooser)ois.readObject();
                                    ois.close();
                                } catch(Exception e) {
                                    // something SNAFU - use fall-back
                                    fileChooser = new JFileChooser();
                                    // configure file chooser..
                                }
                            } else {
                                fileChooser = new JFileChooser();
                                // configure file chooser..
                            }
                        }
                        fileChooser.showOpenDialog(showChooser);
                    }
                });

                JOptionPane.showMessageDialog(null, showChooser);

                if (fileChooser!=null) {
                    try {
                        ObjectOutputStream oos = new ObjectOutputStream(
                            new FileOutputStream(serializedChooser));
                        oos.writeObject(fileChooser);
                        oos.flush();
                        oos.close();
                    } catch(Exception e) {
                        e.printStackTrace();
                    }
                }
            }
        });
    }
}

Правильный ввод-вывод и обработка исключений остаются в качестве упражнения для пользователя.

К сожалению, то, что вы хотите сделать, не является тривиальным. Так должно быть, но это не реализовано таким образом. Отображение каталога и сортировка являются частью LAF. Единственный способ получить желаемое поведение — реализовать собственный BasicFileChooserUI, переопределяющий create/getModel и обеспечивающий реализацию BasicDirectoryModel. Метод сортировки BasicDirectoryModel — это место, где фактически выполняется сортировка.

Я слышал похвалу XFileDialog, но сам не пробовал. Это то, что нужно исследовать, имея в виду, что это только для Windows (возвращается к JFileChooser в OSX или Linux).