Есть ли способ углубить модель PGLMM_compare в R (пакеты Phyr и MuMin)?

Я делаю сравнительный анализ, и мои ответные переменные равны 0 или 1, поэтому мне нужно провести филогенетически скорректированный анализ с биномиальным распределением ошибок. Я использовал функцию PGLMM_compare из пакета phyr (https://rdrr.io/github/daijiang/phyr/man/pglmm_compare.html), чтобы создать полную модель со всеми моими переменными, но MuMin не поддерживает этот вывод как «глобальную модель», поэтому я не могу его углубить. Я ищу способ найти лучшие модели и, возможно, выполнить усреднение моделей по ним, однако кажется, что эти пакеты несовместимы. Вручную создать все модели будет сложно, так как у меня ~ 8 независимых переменных. Есть ли способ углубить филогенетическую модель с биномиальной структурой ошибок? Заранее спасибо.


person CRB    schedule 23.04.2021    source источник


Ответы (1)


Вам потребуется реализовать по крайней мере следующие методы для dredge и model.avg для работы с pglmm_compare:

nobs.pglmm_compare(object, ...) 
logLik.pglmm_compare(object, ...)
coef.pglmm_compare(object, ...) 
coefTable.pglmm_compare(model, ...) 
person Kamil Bartoń    schedule 26.04.2021