Я делаю сравнительный анализ, и мои ответные переменные равны 0 или 1, поэтому мне нужно провести филогенетически скорректированный анализ с биномиальным распределением ошибок. Я использовал функцию PGLMM_compare из пакета phyr (https://rdrr.io/github/daijiang/phyr/man/pglmm_compare.html), чтобы создать полную модель со всеми моими переменными, но MuMin не поддерживает этот вывод как «глобальную модель», поэтому я не могу его углубить. Я ищу способ найти лучшие модели и, возможно, выполнить усреднение моделей по ним, однако кажется, что эти пакеты несовместимы. Вручную создать все модели будет сложно, так как у меня ~ 8 независимых переменных. Есть ли способ углубить филогенетическую модель с биномиальной структурой ошибок? Заранее спасибо.
Есть ли способ углубить модель PGLMM_compare в R (пакеты Phyr и MuMin)?
Ответы (1)
Вам потребуется реализовать по крайней мере следующие методы для dredge
и model.avg
для работы с pglmm_compare
:
nobs.pglmm_compare(object, ...)
logLik.pglmm_compare(object, ...)
coef.pglmm_compare(object, ...)
coefTable.pglmm_compare(model, ...)
person
Kamil Bartoń
schedule
26.04.2021