RegEx игнорирует текст внутри строк в кавычках в .net

Я бы использовал Regex.Replace(). Регулярное выражение будет соответствовать строке без кавычек, за которой следует строка в кавычках, и оценщик соответствия заменит test в части без кавычек. Что-то вроде этого:

Regex.Replace("This is test, 'this is test inside quote' test",
              @"(.*?)((?<quote>[""']).*?\k<quote>|$)",
              m => m.Groups[1].Value.Replace("test", "") + m.Groups[2].Value)

Группа 1 — часть без кавычек, группа 2 — часть в кавычках (или конец строки). Результат вышеизложенного:

This is , 'this is test inside quote' 

Вы можете использовать следующий шаблон, чтобы пропустить строки в кавычках:

s = Regex.Replace(s, @"test|(([""']).*?\2)", "$1");

Для каждого символа вашей строки шаблон может соответствовать строке "test", соответствовать и захватывать строку в кавычках или завершаться ошибкой. Если он захватит группу $1, она будет сохранена после замены, в противном случае совпавшая строка будет удалена.

Рабочий пример: http://ideone.com/jZdMy.

Я бы извлек эти подстроки в кавычках в список (конечно, если у вас больше одной цитаты), создал бы заполнитель на потом (%1,%2 и т. д.), выполнил регулярное выражение и заменил бы заполнители элементами списка.

Я вижу одну двойную кавычку и одну одинарную кавычку в регулярном выражении. Убедитесь, что оба являются одинарными кавычками. Возможно, вам тоже нужно избегать одинарных кавычек. ([\'\']).*?\1