Я использую cophyloplot для создания tanglegram из двух филогенетических деревьев. Этот метод хорошо работает с маленькими деревьями, но по мере того, как деревья становятся больше, выходное изображение остается того же размера, и я не могу найти способ его увеличить.
Ниже приведен код для небольшого дерева, которое отлично работает (в основном то же самое, что и в примере по адресу: https://www.rdocumentation.org/packages/ape/versions/5.4-1/topics/cophyloplot):
library(ape)
#two random trees
TreeA <- rtree(10)
TreeB <- rtree(10)
#creation of the association matrix:
association <- cbind(TreeB$tip.label, TreeB$tip.label)
cophyloplot(TreeA, TreeB, assoc = association, length.line = 4, space = 28, gap = 3)
Это то, что производит небольшой код дерева:
Но когда я использую большие деревья, они становятся нечитаемыми. Например, использование деревьев со 100 подсказками приводит к следующему результату:
Невозможно прочитать этикетки наконечников. Как я могу расширить рендеринг, чтобы он был читабельным?