Я использую Emacs и Mono в Windows, чтобы сохранить ту же среду разработки, пока я работаю в GNU/Linux.
Поэтому мне нужно знать, какова структура каталогов проекта ASP.NET и какие файлы имеют решающее значение для его работы (файлы конфигурации и т. д.).
Вам понадобится файл web.config в корневом каталоге, а также все ваши файлы aspx. Единственное, что вам действительно нужно, это каталог bin под корнем для хранения ваших сборок.
Вам действительно нужна только папка Bin и web.config, как уже упоминалось.
Но если вы не используете веб-проект (скомпилированный сайт), вам понадобится папка App_Code для размещения файлов кода, чтобы сайт знал, что компилировать во время выполнения.
Я бы просто сделал шаблонный проект из IDE, а затем использовал бы его каждый раз, когда вы создаете новый проект.
Используйте MonoDevelop.
