Я повторно запускаю анализ RLQ и 4-го угла, который я закодировал около 6 месяцев назад. Однако при анализе таблицы Q выскакивает ошибка. Я следил за учебником Stephane Dray (2013) и использовал
dudi.pca для таблицы окружения (R, 6 "числовых" переменных на 6 сайтах),
dudi.coa для таблицы присутствия видов (L, 15 видов («целые» данные) по 6 сайтам) и
dudi.hillsmith для таблицы признаков (Q, 7 смешанных признаков (5 "символьных" и 2 "числовых") по 15 видам).
dudi.pca(R), dudi.coa(L) работают нормально, но когда я пытаюсь:
> q_feeding <- dudi.hillsmith(traits_feeding, row.w=l_feeding$cw, scannf=F, nf=2)
я получил
Error in x * w : non-numeric argument to binary operator
Для простоты нашего обсуждения, «кормление» = «присутствие», это 0/1 относительно того, наблюдалось ли кормление вида на каком-либо участке. Эта ошибка также появляется с другими данными и когда L является данными об изобилии. Я попытался изменить категориальные черты на TRUE/FALSE, чтобы посмотреть, будет ли работать «логический». Я в тупике и надеюсь, что это что-то простое, чего мне не хватает.
«row.w=l_feeding$cw» возвращает вектор чисел, который говорит мне, что dudi.coa работает, поэтому я предполагаю, что моя ошибка находится в таблице «traits_feeding»:
> traits_feeding
by fe dus fnt mo se ete
c.notat 0.450 0.673 Y N N N N
c.riat 0.423 0.667 Y N N Y N
z.op 0.501 0.556 N Y N N N
s.liat 0.335 0.596 N Y Y N N
s.i 0.382 0.549 N Y N N N
n.turat 0.354 0.648 N Y Y N N
c.eeke 0.297 0.348 Y Y N Y Y
c.rdid 0.306 0.688 Y Y N Y Y
s.tipinn 0.320 0.658 Y Y N Y N
s.amele 0.302 0.695 Y Y N Y N
s.midiat 0.285 0.678 Y Y N Y N
s.obb 0.294 0.666 Y Y N Y N
s.r 0.338 0.658 Y Y N Y N
s.vulat 0.315 0.684 Y Y N Y N
s.hlege 0.302 0.670 Y Y N Y N
> class(traits_feeding$by)
[1] "numeric"
> class(traits_feeding$fe)
[1] "numeric"
> class(traits_feeding$dus)
[1] "character"
> class(traits_feeding$fnt)
[1] "character"
> class(traits_feeding$mo)
[1] "character"
> class(traits_feeding$se)
[1] "character"
> class(traits_feeding$ete)
[1] "character"
Я использую R 4.0.0 на RStudio 1.2.5042 и использую самую последнюю (16 мая 2020 г.) версию ade4.
Может ли кто-нибудь помочь мне с этим? Самая загадочная часть в том, что шесть месяцев назад это работало без ошибок, я думаю, точно так же, как и здесь...
Спасибо, Райан.
