С чего начать работу с rJava?

Есть «простой» способ сделать это и несколько более сложный способ сделать это. Я простой человек, поэтому я склоняюсь к простому решению:

myCommand <- paste("/path/to/java", argument1, argument2, sep=" ")
system(shQuote(myCommand))

Затем прочитайте выходной файл, используя любую функцию R, которая имеет смысл.

Несколько более сложное решение состоит в том, чтобы отредактировать ваш код Java, чтобы он не читался из стандартного ввода, а передавался вектору или другому объекту Java. Я не могу обобщить, как изменить ваш код Java, но если функции Java в конечном итоге нужно передать вектор, вы должны сделать это примерно так:

.jinit()
v <- .jnew("java/util/Vector")
rVector <- as.character(1:10)
addToV <- function( item ){
  v$add( item )
}
sapply(rVector, addToV)

Я всегда находил работу с типами в rJava довольно болезненной, как вы можете видеть выше.

Один совет, который сэкономит вам значительное время, заключается в следующем: если у вас есть объект Java, созданный в rJava, вы можете определить его методы, набрав имя, знак доллара и нажав клавишу Tab. Итак, используя объект v, созданный выше, введите «v$», и вы должны получить следующее:

1> v$
v$add(                 v$hashCode()           v$contains(            v$size()               v$elementAt(           v$capacity()           v$containsAll(         v$firstElement()       v$removeElement(       v$iterator()           v$wait()
v$get(                 v$clone()              v$isEmpty()            v$toArray()            v$remove(              v$ensureCapacity(      v$removeAll(           v$insertElementAt(     v$removeElementAt(     v$listIterator()       v$getClass()
v$equals(              v$indexOf(             v$lastIndexOf(         v$toArray(             v$elements()           v$trimToSize()         v$retainAll(           v$lastElement()        v$setElementAt(        v$listIterator(        v$notify()
v$toString()           v$clear()              v$addAll(              v$addElement(          v$set(                 v$subList(             v$copyInto(            v$removeAllElements()  v$setSize(             v$wait(                v$notifyAll()
1> v$

Удачи, и обязательно и кричите, если у вас есть конкретные загвоздки.

Это описано в документе по разработке плагина Deducer. Хотя он предназначен для пакетов, расширяющих Deducer, некоторые разделы являются общими.

Запуск методов Java в R: http://www.deducer.org/pmwiki/pmwiki.php?n=Main.Development#wwjoir

Добавление объектов R в java и создание пакета с кодом java: http://www.deducer.org/pmwiki/pmwiki.php?n=Main.Development#suaptijc

Полное раскрытие: Deducer — мой проект.