команда add-migration не работает в ApplicationDbContex

Вы не можете заставить его работать. Потому что EF нужно знать, какую строку подключения следует использовать. Вы можете поместить строку подключения в свой метод OnModelCreating. Что плохо, когда у вас более одной БД (например, для разработки, тестирования и производства). Или вы реализуете IDbContextFactory, который будет загружен EF через отражение.

Так что реализация IDbContextFactory - лучший вариант. Просто создайте его там, где у вас есть ApplicationDbContext. Пример реализации.

public class DomainContextFactory : IDbContextFactory<DomainContext>
{
    public string BasePath { get; protected set; }

    public DomainContext Create()
    {
        var environmentName = Environment.GetEnvironmentVariable("ASPNETCORE_ENVIRONMENT");
        var basePath = AppContext.BaseDirectory;
        return Create(basePath, environmentName);
    }

    public DomainContext Create(DbContextFactoryOptions options)
        => Create(options.ContentRootPath, options.EnvironmentName);

    private DomainContext Create(string basePath, string environmentName)
    {
        BasePath = basePath;
        var configuration = Configuration(basePath, environmentName);
        var connectionString = ConnectionString(configuration.Build());
        return Create(connectionString);
    }

    private DomainContext Create(string connectionString)
    {
        if (string.IsNullOrEmpty(connectionString))
        {
            throw new ArgumentException($"{nameof(connectionString)} is null or empty", nameof(connectionString));
        }
        var optionsBuilder = new DbContextOptionsBuilder<DomainContext>();
        return Configure(connectionString, optionsBuilder);
    }

    protected virtual IConfigurationBuilder Configuration(string basePath, string environmentName)
    {
        var builder = new ConfigurationBuilder()
            .SetBasePath(basePath)
            .AddJsonFile("constr.json")
            .AddJsonFile($"constr.{environmentName}.json", true)
            .AddEnvironmentVariables();
        return builder;
    }

    protected virtual string ConnectionString(IConfigurationRoot configuration)
    {
        string connectionString = configuration["ConnectionStrings:DefaultConnection"];
        return connectionString;
    }

    protected virtual DomainContext Configure(string connectionString, DbContextOptionsBuilder<DomainContext> builder)
    {
        builder.UseSqlServer(connectionString, opt => opt.UseRowNumberForPaging());
        DomainContext db = new DomainContext(builder.Options);
        return db;
    }

    DomainContext IDbContextFactory<DomainContext>.Create(DbContextFactoryOptions options)
        => Create(options.ContentRootPath, options.EnvironmentName);
}

Работает с 3-мя конфигурационными файлами (финальным, локальным и тестовым).

• constr.dev-final.json
• constr.dev-local.json
• constr.dev-test.json

Использование выглядит следующим образом:

public override IServiceResult<IList<Rolle>> LoadAllData()
{
    using (var db = this.DomainContextFactory.Create())
    {
        Task<List<Rolle>> rollen = db.Roles
            .ToListAsync<Rolle>();
        return new ServiceResult<IList<Rolle>>(rollen.Result, rollen.Result.Count);

    }
}

И использование «Add-Migration» внутри MSVC тоже работает.