Как использовать алгоритмы роста регионов для определения интересующей области?

Я работаю над изображениями DICOM (КТ) и хотел бы выделить на моем снимке некоторые структуры, представляющие интерес, такие как человеческие органы (например, аорта, см. прилагаемое изображение). Пишу на С++ с помощью ITK и VTK.

Предположим, что эти органы имеют определенную интенсивность яркости, поэтому я могу автоматически идентифицировать их с помощью алгоритма увеличения области (код ниже). Для этого я предварительно вычислил некоторые пороговые значения, основанные на средних значениях и стандартных отклонениях вокселей, принадлежащих органу.

Как я могу оставить на изображении только аорту с помощью функций ITK/VTK? Я думаю, мне нужен фильтр, который будет делать прямо противоположное 1MaskImageFilter.html" rel="nofollow noreferrer">фильтр изображения маски ITK.

Пожалуйста, найдите (псевдо) код, соответствующий выделению органов ниже. Я вычислил расширение в 5 вокселей в результате наращивания области, чтобы убедиться, что он включает все воксели органа и чтобы после обрезки был достаточный запас вокруг органа.

typedef short InputPixelType;
typedef unsigned char OutputPixelType; 
const int Dimension = 3;

typedef itk::Image< InputPixelType, Dimension > InputImageType;
typedef itk::Image< OutputPixelType, Dimension > OutputImageType;

// Region growing
typedef itk::ConnectedThresholdImageFilter< InputImagetype, 
OutputImagetype > ConnectedFilterType;

ConnectedFilterType::Pointer connectedThreshold = ConnectedFilterType::New();

connectedThreshold->SetInput(input);
connectedThreshold->SetUpper(upperThreshold);
connectedThreshold->SetLower(lowerThreshold);

//Initializing seed
InternalImagetype::IndexType index;
index[0] = seed_x; 
index[1] = seed_y;
connectedThreshold->SetSeed(index);

// Dilate the resulting region-growing of 5 voxels for safety
typedef itk::BinaryBallStructuringElement< OutputImageType, 
Dimension > StructuringElementType;
typedef itk::BinaryDilateImageFilter< OutputImageType, 
OutputImageType, StruturingElementType > DilateFilterType;

StructuringElementType structuringElement;
structuringElement.SetRadius(5);
structuringElement.CreateStructuringElement();

DilateFilterType::Pointer dilateFilter = DilateFilterType::New();
dilateFilter->SetInput(connectedThreshold->GetOutput());
dilatefilter->SetKernel(structuringElement);

// Saving the results of the RG+dilation
typedef itk::ImageFileWriter< OutputImageType > WriterType;
WriterType::Pointer writer = WriterType::New();
writer->SetInput(dilateFilter->GetOutput());
writer->SetFileName("organ-segmented-with-dilation.mhd");
try {
    writer->Update();
} catch(itk::ExceptionObject& err) {
    std::cerr << "Exception caught! " << err.what() << std::endl;
    return EXIT_FAILURE;
}

// What to do next to crop the input image with this region-growing? 

Любая помощь или замечание приветствуется.