Если вы установили neo4j с помощью установщика Windows или Mac (что делает большинство людей), а не из файла zip или tar, тогда папка plugins должна находиться в папке вашей базы данных, а не в папке установки neo4j.
Откройте neo4j.conf по адресу /etc/neo4j/neo4j.conf, замените строку #dbms.security.procedures.whitelist=apoc.coll.*,apoc.load.* на dbms.security.procedures.whitelist=apoc.coll.*,apoc.load.*,apoc.* и сохраните ее.
Перезапустите службу Neo4j, введя команду systemctl restart neo4j
Примечание. Убедитесь, что у вас загружена правильная версия apoc jar. Я использую neo4j version 3.5.5, а версия apoc jar, которую я использую, - apoc-3.5.0.3-all.jar. Алос, убедитесь, что у вас dbms.directories.plugins=/var/lib/neo4j/plugins раскомментированный в /etc/neo4j/neo4j.conf