В настоящее время я пытаюсь создать карту географического ареала нескольких видов животных в национальном парке Ману, Перу. Я хочу построить ранее наблюдаемый географический диапазон вместе с новыми оценочными диапазонами. Я решил, что лучший способ сделать это — построить интервальный график со средней высотой в виде точки, а затем планками погрешностей, представляющими минимальную и максимальную высоты. Вот следующий код, который я создал:
Предыдущий диапазон высот
solm <- data.frame(mean =
c(1160,690,380,365,375,475,675,2685,675,415,905,
1135,3350,400,1460,385, 675, 415,2875),
std.dev = c(760,310,0,15,50,250,300,765,300,35,555,
785,0,50,0,15, 325, 65,425),
class = c("previous"),
group = c("D.marsupialis","D.novemcinctus",
"P.maximus","T.tetrodactyla",
"C.albifrons","S.ignitus","C. paca",
"C. taczanowskii","D.punctata",
"A.microtis","P.flavus","E.barbara",
"M.frenata","L.pardalis","L.tigrinus",
"L.weidii","P.onca", "M.americana",
"M.chunyi"))
solm
##Observed Elevation Range
obsm <- data.frame(mean =
c(1290,825,460,930,920,1165,1050,2740,1275,565,1226,
1900.5,2742.5,550,2363.5,445, 1050, 550,2750),
std.dev = c(890,445,80,580,570,815,700,820,925,185,876,
1550.5,814.5,200,1097.5,75, 700, 200,550),
class = c("observed"),
group = c("D.marsupialis","D.novemcinctus",
"P.maximus","T.tetrodactyla",
"C.albifrons","S.ignitus","C. paca",
"C. taczanowskii","D.punctata",
"A.microtis","P.flavus","E.barbara",
"M.frenata","L.pardalis","L.tigrinus",
"L.weidii","P.onca", "M.americana",
"M.chunyi"))
obsm
##Combo
ggplot()+geom_pointrange(data=obsm, aes(x=group, y=mean, ymax=mean+std.dev,
ymin=mean-std.dev, color="red"))+
geom_pointrange(data=solm, aes(x=group, y=mean, ymax=mean+std.dev,
ymin=mean-std.dev, color="blue"))+
geom_pointrange(position = position_dodge(width = 0.2))+
labs(x="Mammal Species", y="Elevation (m)")+ theme_bw() +
theme(panel.grid.major = element_blank(),panel.grid.minor =
element_blank(),
panel.border = element_blank())+
theme (axis.text.x = element_text(angle = 45, hjust = 1,
face="bold.italic"))+
scale_y_continuous(breaks=c(300, 500, 1000, 1500, 2000, 2500,
3000, 3500, 4000))+
scale_colour_manual(values=c("red", "blue"))
Это сработало очень хорошо, но ggplot2 накладывает диапазоны друг на друга. Я хотел бы немного пошевелить точки, но все, что я пробовал, не работает. Какие-нибудь мысли?
position_jitter()
, но не уверен, что это полезно, так как иногда остается синий, иногда красный. так что это ИМО более запутанно. - person Roman   schedule 17.02.2017