Увеличение скорости O (n ^ 2) и O (n ^ 3) в Matlab, когда n ~ 100K

Я хочу создать график из облаков 3D-точек, захваченных Microsoft Kinect в Matlab. Речь идет всего лишь о 100 тысячах баллов. Я написал очень простую программу, которая является только вложенной, т.е. O (n ^ 2) следующим образом:

load('Points_Sample1.mat')
Points=single(Points);
x=Points(1,:);
y=Points(2,:);
z=Points(3,:);

tic
for i=1:n
    xi=x(i);
    yi=y(i);
    zi=z(i);
   for j=1:n
        xj=x(j);
        yj=y(j);
        zj=z(j);
   end
end
toc

результат:

Elapsed time is 122.398886 seconds.

Другими словами, простой цикл for занимает 122 секунды! Я запускаю его с помощью:

Матлаб 2016а

Windows 10 Корпоративная 64 бит

Intel Core i7-3820 @ 3,6 ГГц с 16 ГБ ОЗУ

На такой скорости я даже не могу думать об O(n^3)

Я хочу запустить всю программу менее чем за 1 с. перед тестированием вышеуказанной программы я ожидал, что она будет работать менее 0,1 секунды.

Редактировать 1:

1) два пользователя комментируют XY! Я хочу создать взвешенный график (структуру данных) из точек и использовать этот график для поиска объектов (размер, положение, направление).

2) один пользователь прокомментировал векторизацию вычислений, это очень хорошо. однако у ПК всего 16 ГБ ОЗУ. для векторизации вычислений с n ~ 100K требуется 128 ГБ!

3) другие комментарии пользователей по нотации O(n^2) и времени выполнения. Любая пеограмма в O (n ^ 3) должна занимать больше времени, чем просто цикл. Я хочу сказать, что когда простой цикл занимает 122 секунды, если я добавлю больше строк, это займет более 122 секунд. Мне нужно уменьшить его до 0,1 секунды (если это невозможно, не более 1 секунды)