Lmfit раздельный козырек

Я новичок в подборе кривой / пика, но я пытаюсь подогнать набор данных с несколькими отдельными независимыми пиками. Я пробовал что-то похожее на пример, предоставленный lmfit, и вот мой код:

import matplotlib.pyplot as plt
from lmfit.models import GaussianModel
from numpy import loadtxt

data = loadtxt('079-55.freq')
x = data[:, 0]
y = data[:, 1]

gauss1 = GaussianModel(prefix='g1_')
pars = gauss1.make_params()
pars['g1_center'].set(4100, min=2000, max=4500)
pars['g1_amplitude'].set(170, min=10)

gauss2 = GaussianModel(prefix='g2_')
pars.update(gauss2.make_params())
pars['g2_center'].set(4900, min=4500, max=5500)
pars['g2_amplitude'].set(30, min=10)

gauss3 = GaussianModel(prefix='g3_')
pars.update(gauss3.make_params())
pars['g3_center'].set(600, min=5500, max=10000)
pars['g3_amplitude'].set(13, min=10)

mod = gauss1 + gauss2 + gauss3

init = mod.eval(pars, x=x)
plt.plot(x, init, 'k--')

out = mod.fit(y, pars, x=x)

print(out.fit_report())

plt.plot(x, out.best_fit, 'r-')
plt.plot(x, y)
plt.show()

Однако результат будет примерно таким:  подобранная кривая

Я очень не понимаю, как подобрать три отдельных пика, как показано ниже. Я думаю, что обновление параметров предназначено для объединения нескольких моделей в один и тот же набор данных, а не для отдельных независимых пиков. Хотя я мог ошибаться. Есть какие-нибудь предложения?


person Linh Phan    schedule 01.06.2016    source источник
comment
Не могли бы вы предоставить данные?   -  person Cleb    schedule 07.06.2016
comment
Я предлагаю начать с более простой модели, скажем, 1 гауссиана, и посмотреть на первоначально предполагаемые значения и уточненные значения. Затем добавьте второй гауссиан.   -  person M Newville    schedule 08.06.2016


Ответы (1)


pars['g3_center'].set(600, min=5500, max=10000) 

Вероятно, сбивает с толку параметр или класс модели, поскольку 600 находится вне границ min и max.

person Andy Meigs    schedule 25.08.2017