Нулевой вывод при печати объекта heatmap.2 в rmarkdown

Я использую rmarkdown через R-Studio и хочу построить heatmap с помощью heatmap.2. Когда я изменяю угол меток столбцов с помощью параметра strCol, я получаю сообщение NULL, которое печатается перед heatmap в выходном PDF-файле.
Приложенный минимальный код воспроизводит проблему:

{r, message=FALSE,warning=FALSE, echo=FALSE}
require(gplots)
data(mtcars)
x  <- as.matrix(mtcars)
heatmap.2(x,srtCol=0)

PDF-файл выглядит как

введите описание изображения здесь

Есть ли способ удалить этот NULL из вывода PDF?


r r-markdown heatmap gplots
person itamar kanter    schedule 05.05.2016    source источник

Ответы (1)


arrow_upward
1
arrow_downward

Попробуйте выполнить следующую модификацию, используя capture.output. Это не NULL для меня.

```{r, message=FALSE,warning=FALSE, echo=FALSE}
require(gplots)
data(mtcars)
x  <- as.matrix(mtcars)
res <- capture.output(heatmap.2(x,srtCol=0))
```

Может быть лучший способ с опцией heatmap.2, но я не видел этого в документации. Это было основано на следующем сообщении SO Подавить вывод одной команды в R.

person steveb    schedule 05.05.2016