Я разрабатываю программу MPI на машине с Linux, где у меня нет доступа к sudo/su. Поскольку моя программа в настоящее время дает сбой, я хотел бы изучить дампы ядра через gdb. К сожалению, так как программа многопоточная, все потоки пишут в один дамп ядра. Поэтому я хотел бы иметь возможность добавлять PID к каждому отдельному дампу ядра для каждого процесса.
Я знаю, что есть способ сделать это через /proc/sys/kernel/core_pattern, однако у меня нет доступа для этого.
Спасибо за любую помощь.
Отладка приложений MPI в системах, которые настроены таким образом, когда у вас нет root-доступа, может быть сложной задачей. Одним из вариантов решения этой проблемы является использование Valgrind для получения трассировки стека для ваших ошибок сегментации. Это будет полезно только в том случае, если ваше приложение выйдет из строя через разумный период времени при замедлении через Valgrind, и что в этом случае оно все еще будет segfaults.
Я обычно запускаю приложения MPI под Valgrind следующим образом:
% mpiexec -n 5 valgrind -q /path/to/my_app
Это отправит весь вывод Valgrind в стандартную ошибку. Но если я хочу, чтобы вывод был разделен на разные файлы, вы можете немного пофантазировать:
% mpiexec -n 5 valgrind -q --log-file='vg_out.%q{PMI_RANK}' /path/to/my_app
Это установка для MPICH2. Я думаю, что для Open MPI вам нужно будет заменить PMI_RANK на OMPI_MCA_ns_nds_vpid, но если это не сработает для вас, вам нужно будет проконсультироваться с разработчиками Open MPI в их списке обсуждений. В любом случае это даст N файлов, где N — размер MPI_COMM_WORLD, каждый с именами от vg_out.0, vg_out.1, ... до vg_out.$(($N-1)), каждый соответствует рангу в MPI_COMM_WORLD.
