У меня есть вопрос, похожий на этот (ссылка), за исключением того, что мой вопрос относится к java-инструменту «h2o» и его связи с «r».
В частности, я хочу назначить объект "h2o" части вектора (или структуры, или массива. Я хочу перебрать и сохранить несколько из них без необходимости вручную перечислять.
Я попробовал решение по ссылке, но оно не работает для объектов «h2o».
Вот мой более длинный код (бородавки и все такое):
#libraries
library(h2o) #for tree control
#specify data
mydata <- iris[iris$Species!="setosa",]
mydata$Species <- as.factor(as.character(mydata$Species))
#most informative variable is petal length
x1 <- mydata$Petal.Length
x2 <- mydata$Petal.Width
#build classes
C <- matrix(0,nrow=length(x1),ncol=1)
idx1 <- which(mydata$Species == "versicolor",arr.ind=T)
idx2 <- which(mydata$Species != "versicolor",arr.ind=T)
C[idx1] <- +1
C[idx2] <- 0
#start h2o
localH2O = h2o.init(nthreads = -1)
# Run regression GBM on iris.hex data
irisPath = system.file("extdata", "iris.csv", package="h2o")
iris.hex = h2o.uploadFile(localH2O, path = irisPath)
names(iris.hex) <- c("Sepal.Length",
"Sepal.Width",
"Petal.Length",
"Petal.Width",
"Species" )
iris2 <- iris
iris2$Species <- unclass(iris$Species)
iris2.hex <- as.h2o(iris2)
iris.hex$Species <- as.factor(iris2.hex$Species)
independent <- c("Sepal.Length","Sepal.Width","Petal.Length","Petal.Width")
dependent <- "Species"
mare <- numeric()
mae <- matrix(1,nrow=10,ncol=1)
est2.h2o <- vector(mode="list", length=150)
for (i in 1:150){
est2.h2o[[i]] <- h2o.gbm(y = dependent,
x = independent,
training_frame = iris.hex,
distribution="AUTO",
ntrees = i, max_depth = 3, min_rows = 2,
learn_rate = 0.5)
pred <- h2o.predict(est2.h2o,newdata=iris.hex)
err <- iris2$Species-(as.data.frame(pred)$predict+1)
mae[i] <- mean(abs(err))
mare[i] <- mean(abs(err)/iris2$Species)
print(c(i,log10(mae[i])))
}
Я получаю следующую ошибку:
Error in paste0("Predictions/models/", object@model_id, "/frames/", newdata@frame_id) :
trying to get slot "model_id" from an object of a basic class ("list") with no slots
Мое намерение состоит в том, чтобы иметь список / структуру / массив GBM, для которого я затем могу выполнить прогнозирование для всего набора данных и отбраковать менее информативные. Я пытаюсь сделать приличный "случайный лес из gbt" по стопам Евгения Тув. У меня нет его кода.
Вопросы:
Есть ли правильный способ упаковать H2O gbm вместе с несколькими (сотнями) его приятелей в один магазин в r?
Если объект, на который указывает ссылка, выброшен в java, что делает такой подход невозможным, существует ли возможный вариант с использованием библиотеки gbm? Если мне придется использовать gbm, какова разница в скорости по сравнению с h2o?
lapply
на 1: 150, вы получите свой список, тогда я считаю, чтоsapply(est.h2o, h2o.predict, newdata = iris.hex)
должен сгенерировать data.frame, а затем вы можете выполнить оставшееся как векторные вычисления. Ошибка, которую вы получаете, связана с использованием объекта неправильного типа - person Shape   schedule 26.11.2015