Ошибка при записи образа ITK

Я удаляю шум с изображения, как описано в Pyscience следующим образом:

import SimpleITK as sitk

image=sitk.ReadImage("myimage.dcm")
imgSmooth = sitk.CurvatureFlow(image1=image,
                                timeStep=0.00125,
                                numberOfIterations=100)

И я пытаюсь сохранить его как файл dicom:

sitk.WriteImage(imgSmooth, 'denoised.dcm')

Но у меня возникает следующая ошибка:

RuntimeError: Exception thrown in SimpleITK WriteImage:     ..\..\..\..\..\ITK\Modules\IO\GDCM\src\itkGDCMImageIO.cxx:1035:
itk::ERROR: GDCMImageIO(000000000F268380): A Floating point buffer was   passed but the stored pixel type was not specified.This is currently not supported

Я не могу вообще сохранить как файл dicom с помощью SimpleITK? Как сохранить дешумированное изображение в формате dicom?


dicom itk
person DimKoim    schedule 31.07.2015    source источник
comment
Поскольку я столкнулся с серьезной проблемой, может ли кто-нибудь дать мне несколько советов?   -  person DimKoim    schedule 31.07.2015
comment
Вы пытались преобразовать свое изображение обратно в короткометражку с подписью?   -  person blowekamp    schedule 26.08.2015

Ответы (1)


arrow_upward
6
arrow_downward

Я думаю, вам нужно преобразовать float в int (или uint).

castFilter = sitk.CastImageFilter()
castFilter.SetOutputPixelType(sitk.sitkInt16)

# Convert floating type image (imgSmooth) to int type (imgFiltered)
imgFiltered = castFilter.Execute(imgSmooth)

sitk.WriteImage(imgFiltered, 'denoised.dcm')
person S. Sashida    schedule 20.04.2016