Параллелизм потоков записи HDF5

Энкорн,

HDF5 может обрабатывать несколько потоков без внешней синхронизации, хотя запись по-прежнему будет последовательной. Вы должны скомпилировать последнюю версию (1.8.6 от 05.04.2011) и запустить ./configure с флагами --enable-threadsafe и -with-pthreads=/pthreads-include-path/,/pthreads-lib-path/.

Например:

./configure --enable-threadsafe -with-pthreads=/usr/include,/usr/lib

Что касается определения пространства данных для записи, самый простой способ — построить базовую прямоугольную гиперплоскость, используя многомерный массив, значение ранга и функцию H5Screate_simple. Мои обычно выполняют те же действия:

    //NUM = Number of spaces in this dimension
    //Create a 1 dimensional array
    hsize_t dsDim[1] = {NUM};
    //Create the 1x1xNUM data space (rank param = 1).
    hid_t dSpace = H5Screate_simple(1, dsDim, NULL);
    ...
    Create datasets using the dataspace
    ...
    //Release the data space
    H5Sclose(dSpace);

Надеюсь это поможет!