Аннотировать диаграмму Венна в R

Мой вопрос касается того, как аннотировать диаграмму Венна фактическими значениями в дополнение к счетчикам по умолчанию, используя любой пакет R. Ниже приведен минимальный пример данных:

list.items <- list(method1=c("item1","item2","item3","item4","item5","item6"), 
                   method2=c("item1","item7","item3","item4","item8","item6"), 
                   method3=c("item1","item7","item9","item4","item10","item11"))
library(gplots)
venn(list.items)

Это возвращает диаграмму Венна: введите здесь описание изображенияЯ хотел бы увидеть, например, какие 3 элемента имеет метод3 на самом деле? например пункт 3, пункт 5 и пункт 7.

Я хотел бы иметь диаграмму Венна, подобную приведенной в: " rel="nofollow noreferrer">http://openi.nlm.nih.gov/detailedresult.php?img=3026361_1471-2105-11-S6-S14-9&req=4 Будем очень признательны за любую помощь.


r venn-diagram
person amo    schedule 24.04.2015    source источник

Ответы (1)


arrow_upward
-1
arrow_downward

Из документации видно, что невозможно делать то, что вы хотите, с gtools и gplots. Можно использовать пакет vennDiagram или Vennerable из введите здесь описание ссылки Р-Фордж.

Но вот один из способов отображения элементов с помощью пакета venneuler.

library("venneuler")
df <- data.frame(method1=c("item1","item2","item3","item4","item5","item6"),
                 method2=c("item1","item7","item3","item4","item8","item6"),
                 method3=c("item1","item7","item9","item4","item10","item11"))
vd <- venneuler(df)
plot(vd)

введите здесь описание изображения

person lawyeR    schedule 25.04.2015
comment
Три круга ожидаются для трех методов (не элементов) и элементов внутри трех кругов. - person amo; 13.05.2015