Я пытаюсь использовать перекрестную проверку для тестирования моего классификатора с помощью Sklearn.
У меня 3 класса, всего 50 образцов.
- В классе 1: 5 образцов
- В классе 2: 15 образцов
- Класс 3: 30 образцов
Следующие запуски выполняются, как и ожидалось, что предположительно дает 5-кратную перекрестную проверку.
result = cross_validation.cross_val_score(classifier, X, y, cv=5)
Я пытаюсь сделать одноразовое исключение с использованием cv = 50 сгибов, поэтому я делаю следующее:
result = cross_validation.cross_val_score(classifier, X, y, cv=50)
Однако, что удивительно, это дает следующую ошибку:
/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/cross_validation.py:413: Warning: The least populated class in y has only 5 members, which is too few. The minimum number of labels for any class cannot be less than n_folds=50.
% (min_labels, self.n_folds)), Warning)
/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/core/_methods.py:55: RuntimeWarning: Mean of empty slice.
warnings.warn("Mean of empty slice.", RuntimeWarning)
/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/Extras/lib/python/numpy/core/_methods.py:67: RuntimeWarning: invalid value encountered in double_scalars
ret = ret.dtype.type(ret / rcount)
Traceback (most recent call last):
File "b.py", line 96, in <module>
scores1 = cross_validation.cross_val_score(classifier, X, y, cv=50)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/cross_validation.py", line 1151, in cross_val_score
for train, test in cv)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/externals/joblib/parallel.py", line 653, in __call__
self.dispatch(function, args, kwargs)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/externals/joblib/parallel.py", line 400, in dispatch
job = ImmediateApply(func, args, kwargs)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/externals/joblib/parallel.py", line 138, in __init__
self.results = func(*args, **kwargs)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/cross_validation.py", line 1240, in _fit_and_score
test_score = _score(estimator, X_test, y_test, scorer)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/cross_validation.py", line 1296, in _score
score = scorer(estimator, X_test, y_test)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/metrics/scorer.py", line 176, in _passthrough_scorer
return estimator.score(*args, **kwargs)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/base.py", line 291, in score
return accuracy_score(y, self.predict(X), sample_weight=sample_weight)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/neighbors/classification.py", line 147, in predict
neigh_dist, neigh_ind = self.kneighbors(X)
File "/Library/Python/2.7/site-packages/sklearn/neighbors/base.py", line 332, in kneighbors
return_distance=return_distance)
File "binary_tree.pxi", line 1307, in sklearn.neighbors.kd_tree.BinaryTree.query (sklearn/neighbors/kd_tree.c:10506)
File "binary_tree.pxi", line 226, in sklearn.neighbors.kd_tree.get_memview_DTYPE_2D (sklearn/neighbors/kd_tree.c:2715)
File "stringsource", line 247, in View.MemoryView.array_cwrapper (sklearn/neighbors/kd_tree.c:24789)
File "stringsource", line 147, in View.MemoryView.array.__cinit__ (sklearn/neighbors/kd_tree.c:23664)
ValueError: Invalid shape in axis 0: 0.
Еще одна странность: когда я использую cv = 5, я не получаю никаких предупреждений. Когда я делаю cv = 50, я получаю указанное выше предупреждение, которое выглядит странно. Потому что я думаю, что когда cv становится больше, даже если это может быть сложнее в вычислительном отношении, результат должен быть более точным. Есть ли какие-нибудь пробелы в моих рассуждениях? Почему я получаю предупреждение и ошибку?
Как правильно выполнить перекрестную проверку исключения по одному в этом сценарии?