Как мне избавиться от ПРИМЕЧАНИЕ, сгенерированного проверкой R CMD при использовании, например, ddply в моем пакете?

У меня есть проблема, похожая, но отличная от Как я могу обрабатывать R CMD, проверяя отсутствие видимой привязки для глобальных переменных, когда мой синтаксис ggplot2 разумен?.

В этом случае все работает гладко, используя aes_string вместо aes. Однако с plyr afaik это невозможно.

Проблема возникает, когда я ссылаюсь на имена столбцов в своем фрейме данных, например, через ddply.

ddply(mydf, .(VarA, VarB, VarC, VarD), summarize, sum = sum(VarE))
#
# MyPackage: no visible binding for
#   global variable ‘VarA’

Этот код полностью действителен и разумен, и хотя я понимаю использование ПРИМЕЧАНИЕ, они все еще загромождают другие сообщения в окнах вывода, что затрудняет разработку пакета и фактически заставляет разработчиков игнорировать ПРИМЕЧАНИЯ.

Каков правильный способ избавиться от этих заметок? Или, в качестве альтернативы, как правильно написать код таким образом, чтобы проверка R CMD принимала без указания ПРИМЕЧАНИЕ?

Лучший, Майкл


r warnings package-development plyr r-package
person Dr. Mike    schedule 04.03.2015    source источник

Ответы (2)


arrow_upward
5
arrow_downward

Есть несколько обходных путей. Проще всего просто присвоить NULL всем переменным без видимой привязки.

VarA <- VarB <- VarC <- VarD <- VarE <- NULL

Более элегантное решение — использовать as.quoted и substitute. ОБНОВЛЕНИЕ от @Dr. Майк: вызов as.quoted нужно инкапсулировать в c().

ddply(mydf, 
      as.quoted(c('VarA', 'VarB', 'VarC', 'VarD')), 
      summarize, 
      sum = sum(substitute(VarE)))
person shadow    schedule 04.03.2015

arrow_upward
0
arrow_downward

Вы можете избежать предупреждений о проверке CMD, объявив глобальные переменные:

globalVariables(c("VarA", "VarB"))

Пожалуйста, прочтите ?globalVariables перед использованием и убедитесь, что в ОПИСАНИЕ добавлена ​​соответствующая версия R.

Всегда предпочтительнее избегать использования глобальных переменных в кавычках.

person Axeman    schedule 16.01.2017