Какой тип объекта представляет собой пакет R?

Пакеты R обычно распространяются в виде сжатых пакетов файлов. Они могут быть либо в «бинарной» форме, которые предварительно обрабатываются в репозитории для компиляции любого исходного кода C или Fortran и создания соответствующих заголовков, либо они могут быть в исходной форме, где доступны различные необходимые файлы для использования в процессе установки, но для этого требуется, чтобы у пользователей были установлены необходимые компиляторы и инструменты в местах, где процесс сборки R с использованием системных ресурсов ОС может их достать.

Если вы читаете документацию к пакету в CRAN, вы видите, что они распространяются в наборе сжатых форматов, которые различаются в зависимости от целей ОС:

Package source:     Rcpp_0.11.3.tar.gz  # the Linus/UNIX targets
Windows binaries:   r-devel: Rcpp_0.11.3.zip, r-release: Rcpp_0.11.3.zip, r-oldrel: Rcpp_0.11.3.zip
OS X Snow Leopard binaries:     r-release: Rcpp_0.11.3.tgz, r-oldrel: Rcpp_0.11.3.tgz
OS X Mavericks binaries:    r-release: Rcpp_0.11.3.tgz
Old sources:    Rcpp archive   # not really a file but a web link

После установки пакет R будет иметь указанную структуру каталогов. Файл DESCRIPTION — это текстовый файл с конкретными записями для компонентов, которые определяют, соответствует ли локальная установка зависимостям пакета. Есть файлы NAMESPACE, LICENSE и INDEX. Существуют каталоги с именами '/help', '/html', '/Meta', '/R' и, возможно, '/libs', '/demo', '/data', '/unitTests' и другие.

Это дерево в верхней части каталога пакетов ../library/Rcpp:

$ ls
CITATION    NAMESPACE   THANKS      examples    libs
DESCRIPTION NEWS.Rd     announce    help        prompt
INDEX       R       discovery   html        skeleton
Meta        README      doc     include     unitTests

Таким образом, в «жизненном цикле» пакета изначально будет ряд обязательных и необязательных файлов, которые затем обрабатываются механизмами BUILD и CHECK в установленный пакет, который затем сжимается для распространения, а затем распаковывается. в указанное дерево каталогов на компьютере пользователя. См. эти страницы справки:

?.libPaths  # also describes .Library()
?package.skeleton
?install.packages
?INSTALL

И, конечно же, прочтите «Написание расширений R» — документ, который поставляется с каждой установкой R.

Ваш вопрос:

Какой тип объекта представляет собой пакет R?

Почему-то мне до сих пор не хватает ответа на этот точный вопрос. Итак, вот:

Что касается R, пакет R не является объектом. То есть это не объект в системе типов R. R немного сложен, потому что он позволяет вам писать

library(pkg_name)

Не требуя от вас определения pkg_name где-либо ранее. Напротив, другие объекты, которые вы используете в R, должны где-то определяться — либо вами, либо каким-либо пакетом, который загружается явно или неявно.

Это печально и смущает людей. Поэтому, когда вы видите library(pkg_name), думайте

library('pkg_name')

То есть представьте имя пакета в кавычках. Это на самом деле работает так, как ожидалось. Тот факт, что код также работает без кавычек, является особенностью функции library, известной как нестандартная оценка . В данном случае это скорее неудачное дизайнерское решение (но на то есть причины).

Из собственной документации R:

Пакеты предоставляют механизм для загрузки дополнительного кода, данных и документации по мере необходимости… Пакет — это каталог файлов, которые расширяют R, исходный пакет (основные файлы пакета) или архив, содержащий файлы исходного пакета, или установленный пакет, результат выполнения команды R CMD INSTALL для исходного пакета. На некоторых платформах (особенно OS X и Windows) существуют также бинарные пакеты, zip-файл или tar-архив, содержащие файлы установленного пакета, которые можно распаковать, а не устанавливать из исходников. Пакет не является библиотекой.

Так что да, пакет — это не функции внутри него; это механизм, позволяющий R использовать функции или данные, составляющие пакет. Таким образом, он должен быть загружен в первую очередь.

Я читаю книгу Хэдли Advanced-R (глава 6.3 - функции, стр. 79). ) и эта цитата вас покроет, я думаю:

Every operation is a function call
“To understand computations in R, two slogans are helpful:

Everything that exists is an object.
Everything that happens is a function call."
— John Chambers

В соответствии с этим использование library(name_of_library) — это вызов функции, которая загрузит пакет. Каждый бит, который был загружен, то есть функции или наборы данных, objects, которые вы можете использовать, вызывая другие функции. В этом смысле пакет не является object ни в одной из сред R, пока он не загружен. Тогда вы можете сказать, что это набор objects, которые он содержит и которые загружены.