build.gradle для проекта eclipse с несколькими исходными папками

У меня есть проект eclipse с исходными папками, например:

/src/main/java/module1
/src/main/java/module2
/src/main/java/module3

внутри этих папок src у меня есть такие пакеты, как:

com.example.module1.xxx
com.example.module2.yyy
com.example.module3.zzz

Я сделал сборку gradle с использованием плагинов java и eclipse с такими исходными кодами, как:

apply plugin: 'java'
apply plugin: 'eclipse'
sourceSets {
    main {
        java {
            srcDirs = ['src/main/java/module1']
            srcDir 'src/main/resources'
            srcDir 'src/main/java/module2'
            srcDir 'src/main/java/module3'
        }
    }
}
jar{
    manifest {
        attributes 'Implementation-Title': 'Example Project',
                   'Implementation-Version': '1.0.0'    
    }
}

repositories {
    mavenCentral()
}
dependencies{
    compile group: 'com.zaxxer', name: 'HikariCP', version: '2.2.5'
    compile group: 'org.apache.logging.log4j', name: 'log4j-api', version: log4j2Version
    compile group: 'org.apache.logging.log4j', name: 'log4j-core', version: log4j2Version
    compile group: 'org.apache.logging.log4j', name: 'log4j-slf4j-impl', version: log4j2Version
    compile group: 'org.apache.logging.log4j', name: 'log4j-jul', version: log4j2Version
    compile group: 'org.apache.logging.log4j', name: 'log4j-jcl', version: log4j2Version
    compile group: 'org.slf4j', name: 'slf4j-api', version: '1.7.9'
}

Проблема в том, что когда я создаю проект eclipse, используя gradle eclipse, он правильно генерирует 3 исходные папки модуля, исходную папку ресурсов, но он также генерирует супер-исходную папку src / main / java, имеющую все вложенные исходные папки с такими пакетами, как:

module1.com.exaple.module1.xxx
module2.com.exaple.module2.yyy
module3.com.exaple.module3.zzz

Таким образом, я получаю сообщение об ошибке в eclipse: «Не могу вложить '$ {projectdir} / src / main / java / module1' внутри '$ {projectdir} / src / main / java'. Чтобы включить вложение, исключите 'module1 /' из '$ { каталог проекта} / src / main / java '"

Как мне изменить свои задачи / наборы источников, чтобы получить правильную структуру проекта?