Как организовать графики GGally с помощью gridExtra?

К сожалению, я не понимаю, как это возможно.

Во-первых, он не будет работать с gridExtra, поскольку arrangeGrob работает с TableGrob объектами:

> ggplotGrob(qplot(1:100))
stat_bin: binwidth defaulted to range/30. Use 'binwidth = x' to adjust this.
TableGrob (6 x 5) "layout": 8 grobs
  z     cells       name                                 grob
1 0 (1-6,1-5) background      rect[plot.background.rect.3349]
2 3 (3-3,3-3)     axis-l absoluteGrob[GRID.absoluteGrob.3341]
3 1 (4-4,3-3)     spacer                       zeroGrob[NULL]
4 2 (3-3,4-4)      panel               gTree[GRID.gTree.3329]
5 4 (4-4,4-4)     axis-b absoluteGrob[GRID.absoluteGrob.3335]
6 5 (5-5,4-4)       xlab         text[axis.title.x.text.3343]
7 6 (3-3,2-2)       ylab         text[axis.title.y.text.3345]
8 7 (2-2,4-4)      title           text[plot.title.text.3347]

Внутреннее представление объекта ggpairs содержит только вызываемые методы, но не фактические грубы:

> str(p1$plots)
List of 9
 $ : chr "ggally_diagAxis(ggally_data, ggplot2::aes(x = var1))"
 $ : chr "ggally_cor(ggally_data, ggplot2::aes(x = var2, y = var1))"
 $ : chr "ggally_cor(ggally_data, ggplot2::aes(x = var3, y = var1))"
 $ : chr "ggally_points(ggally_data, ggplot2::aes(x = var1, y = var2))"
 $ : chr "ggally_diagAxis(ggally_data, ggplot2::aes(x = var2))"
 $ : chr "ggally_cor(ggally_data, ggplot2::aes(x = var3, y = var2))"
 $ : chr "ggally_points(ggally_data, ggplot2::aes(x = var1, y = var3))"
 $ : chr "ggally_points(ggally_data, ggplot2::aes(x = var2, y = var3))"
 $ : chr "ggally_diagAxis(ggally_data, ggplot2::aes(x = var3))"

Всю работу по созданию настоящих гробов выполняет GGally:::print.ggpairs. Взгляните на исходный код, и вы увидите grid.newpage() вместе с несколькими popViewport и pushViewport. Это означает, что даже низкоуровневый grid подход (например, описанный здесь) неприменимо, так как ваши grid конструкции будут перезаписаны GGally:::print.ggpairs.

Конечно, выход есть всегда. Всегда можно изменить исходный код, хотя я считаю, что это долгий и трудный путь для решения вашей задачи. Я был бы счастлив, если бы ошибся, если кто-нибудь найдет простое решение.

library(GGally)
library(gridExtra)
library(grid)

# reproducing initial data
df <- structure(list(var1 = 1:5, var2 = 4:8, var3 = 6:10), 
                .Names = c("var1", "var2", "var3"), 
                row.names = c(NA, -5L), class = "data.frame")
p1 <- ggpairs(df, 1:3) 
p2 <- ggpairs(df, 1:2)

# declaring new method for drawing ggmatrix objects using grid.draw
grid.draw.ggmatrix <- function(x, recording = T) print(x, gridNewPage = F)
# then making them look like grob objects
attributes(p1)$class <- c(attributes(p1)$class, "grob")
attributes(p2)$class <- c(attributes(p2)$class, "grob")

p <- arrangeGrob(p1, p2, ncol=2)
grid.newpage()
grid.draw(p)

Только что нашел ответ, как решить эту проблему с помощью cowplot (находится на https://github.com/ggobi/ggally/issues/256)

Решение:

 library(GGally)
 library(gridExtra)
 library(cowplot)

 df <- structure(list(var1 = 1:5,var2 = 4:8, var3 = 6:10), 
                      .Names = c("var1",  "var2", "var3"),
                      row.names = c(NA, -5L), class = "data.frame")

 p1 <- ggpairs(df, 1:3) 
 p2 <- ggpairs(df, 1:2)



 plot_grid(
   ggmatrix_gtable(p1),
   ggmatrix_gtable(p2),
   nrow = 2)