Чтение данных с нескольких рабочих листов из рабочей книги и удаление комментариев

У меня есть книги с несколькими (70+) листами. Каждый рабочий лист представляет собой название станции. Каждый рабочий лист имеет разное количество строк комментариев, начинающихся с #, которые я хочу исключить, затем прочитайте заголовок, когда комментарии заканчиваются, и назначьте их именам столбцов. Я пытался использовать RODBC, который работает на 32-битной машине/R/EXCEL, но не работает на 64-битной системе. Ниже то, что у меня есть, используя RODBC. Как я могу сделать то же самое, используя XLconnect или что-то еще для 64-битной системы?

library(RODBC)
### Connect to Excel Files
# Input
excel.input <- odbcConnectExcel2007("Diurnal Data 2013.xlsx")
# Output
excel.output <- odbcConnectExcel("Diurnal Data 2013 edit.xls", readOnly=FALSE)
### Pull and Format Data
#extract and keep Stations sheet
Stations <-sqlFetch(excel.input, "Stations", na.strings=c("","-")) 
sqlSave(excel.output,Stations,  rownames = FALSE)
##Loop through data pull and formatting for each site id
sites <- gsub("[[:punct:]]","",sqlTables(excel.input)[,"TABLE_NAME"])
len <- length(sites)
for(i in 2:len) { # Omit the 1st worksheet
sheet <- sites[i]
data <- sqlFetch(excel.input, sheet, na.strings=c("","-")) ##retrieve data from each worksheet   ith sheet
data1 <- subset(data, !grepl("^#", data[,1])) ## Removes rows starting  with #(hashtag) on ith sheet
# Rename to appropriate column headers
A <- t(data1[1,])
names(data1)<- A[,1] 
# Remove unwanted rows
data2 <- data1[c(-1,-2),]
head(data2)
# Write new ith worksheet into output file.
sqlSave(excel.output,data2, tablename=sheet, rownames = FALSE)
# End loop after running through all sheets.
}
###Close connections to Excel files before opening
odbcCloseAll()

person user2653586    schedule 01.05.2014    source источник
comment
Я не могу загрузить рабочие книги с помощью XLConnect, так как рабочая книга слишком большая (>31 МБ). Получение ошибки Ошибка: OutOfMemoryError (Java): превышен лимит накладных расходов GC   -  person user2653586    schedule 01.05.2014
comment
Используете ли вы версии R и Office для одной и той же архитектуры? (т.е. 64-битный R и 64-битный Excel). RODBC дает сбой при использовании драйверов для архитектуры, отличной от используемой в R.   -  person Oscar de León    schedule 01.05.2014
comment
Вы должны публиковать точные сообщения об ошибках и более подробную информацию о версиях. sessionInfo() вывод должен быть включен.   -  person IRTFM    schedule 02.05.2014
comment
Хотя odbcConnectExcel не работал на моей машине с 64-битной Windows, мне пришлось переустановить 64-битный MS Office и установить 64-битные драйверы ODBC для офисных файлов (microsoft.com/en-us/download/details.aspx?id=13255). Это выровняло ОС и Office, и большая часть скрипта заработала.   -  person user2653586    schedule 06.05.2014
comment
Спасибо, Оскар. Ваше предложение помогло мне разобраться.   -  person user2653586    schedule 07.05.2014