AttributeError: объект «str» не имеет атрибута «_ptr» в функции Numba @autojit

Я пытаюсь начать работу с Numba, и после его установки мой первый опыт был со следующим фрагментом кода:

from numba import autojit

@autojit
def trial(a,b):
    return a+b

trial(1,1)

Я получаю следующую ошибку, которая говорит мне, что autojit неправильно интерпретирует тип переменной, но не говорит мне больше. (То же самое происходит с другими способами обертывания функции, например @jit(...).) Проблема аналогична this, но не зависит от операции: это происходит независимо от того, что делает функция или насколько она проста (как показано в примере). Любые предложения о том, что проблема может быть? Работает в Ubuntu 12.04 и устанавливается в соответствии с инструкциями на Github.

---------------------------------------------------------------------------
AttributeError                            Traceback (most recent call last)
<ipython-input-1-653102b59b98> in <module>()
      5     return a+b
      6 
----> 7 trial(1,1)

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/numbawrapper.so in numba.numbawrapper._NumbaSpecializingWrapper.__call__ (numba/numbawrapper.c:3934)()

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/wrapping/compiler.pyc in compile_from_args(self, args, kwargs)
     67     def compile_from_args(self, args, kwargs):
     68         signature = self.resolve_argtypes(args, kwargs)
---> 69         return self.compile(signature)
     70 
     71     def compile(self, signature):

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/wrapping/compiler.pyc in compile(self, signature)
     86                      env=self.env, func_ast=self.ast, **self.flags)
     87 
---> 88         compiled_function = dec(self.py_func)
     89         return compiled_function
     90 

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/decorators.pyc in _jit_decorator(func)
    222         sig, lfunc, wrapper = compile_function(env, func, argtys,
    223                                                restype=return_type,
--> 224                                                nopython=nopython, func_ast=func_ast, **kwargs)
    225         return numbawrapper.create_numba_wrapper(func, wrapper, sig, lfunc)
    226 

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/decorators.pyc in compile_function(env, func, argtypes, restype, func_ast, **kwds)
    131     assert kwds.get('llvm_module') is None, kwds.get('llvm_module')
    132 
--> 133     func_env = pipeline.compile2(env, func, restype, argtypes, func_ast=func_ast, **kwds)
    134 
    135     function_cache.register_specialization(func_env)

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/pipeline.pyc in compile2(env, func, restype, argtypes, ctypes, compile_only, func_ast, **kwds)
    142         pipeline = env.get_pipeline(kwds.get('pipeline_name', None))
    143         func_ast.pipeline = pipeline
--> 144         post_ast = pipeline(func_ast, env)
    145         func_signature = func_env.func_signature
    146         symtab = func_env.symtab

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/pipeline.pyc in __call__(self, ast, env)
    189 
    190         if self.is_composed:
--> 191             ast = self.transform(ast, env)
    192         else:
    193             try:

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/pipeline.pyc in transform(self, ast, env)
    654                 stage_tuple = (stage, utils.ast2tree(ast))
    655                 logger.debug(pprint.pformat(stage_tuple))
--> 656             ast = stage(ast, env)
    657         return ast
    658 

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/pipeline.pyc in _stage(ast, env)
    639             def _stage(ast, env):
    640                 stage_obj = getattr(env.pipeline_stages, name)
--> 641                 return _check_stage_object(stage_obj)(ast, env)
    642             _stage.__name__ = name
    643             stage = _stage

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/pipeline.pyc in __call__(self, ast, env)
    192         else:
    193             try:
--> 194                 ast = self.transform(ast, env)
    195             except error.NumbaError as e:
    196                 func_env = env.translation.crnt

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/pipeline.pyc in transform(self, ast, env)
    551             **func_env.kwargs)
    552 
--> 553         func_env.translator.translate()
    554         func_env.lfunc = func_env.translator.lfunc
    555         return ast

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/codegen/translate.pyc in translate(self)
    327         self.lfunc = None
    328         try:
--> 329             self.setup_func()
    330             if isinstance(self.ast, ast.FunctionDef):
    331                 # Handle the doc string for the function

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/codegen/translate.pyc in setup_func(self)
    304 
    305         # TODO: Put current function into symbol table for recursive call
--> 306         self.setup_return()
    307 
    308         if self.have_cfg:

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/numba/codegen/translate.pyc in setup_return(self)
    471             llvm_ret_type = self.func_signature.return_type.to_llvm(self.context)
    472             self.return_value = self.builder.alloca(llvm_ret_type,
--> 473                                                     "return_value")
    474 
    475         # All non-NULL object emporaries are DECREFed here

/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/llvm/core.pyc in alloca(self, ty, size, name)
   2303 
   2304     def alloca(self, ty, size=None, name=""):
-> 2305         sizeptr = size._ptr if size else None
   2306         return _make_value(self._ptr.CreateAlloca(ty._ptr, sizeptr, name))
   2307 

AttributeError: 'str' object has no attribute '_ptr'

Изменить: в ответ на @JoshAdel я использовал инструкции для «Пользовательские среды Python» на странице Github с моим LLVM_BUILD_DIR=/opt/. Из CHANGE_LOG в репозитории я беру установленную мной версию 0.11. Если я запущу приведенный вами пример, я получу

from numba import autojit, typeof

@autojit
def trial(a,b):
    print typeof(a), typeof(b)
    return a+b

trial(1,1)

которому

  File "<unknown file>", line 2
    print typeof(a), typeof(b)
               ^
SyntaxError: invalid syntax

Если я уберу @autojit, все будет нормально. То, что он выдает SyntaxError при вызове @autojit, безусловно, является подсказкой, но я достаточно новичок в этом, поэтому не могу сказать, что...

Кроме того, если это имеет значение, я запускаю это в блокноте IPython, чтобы numpy, scipy и matplotlib автоматически загружались при запуске.


person user3230304    schedule 24.01.2014    source источник
comment
Я предполагаю, что это внутренняя проблема онемения, если вы не ошибаетесь.   -  person aIKid    schedule 24.01.2014
comment
Кроме того, numpy, scipy и т. д. загружаются автоматически только в IPython, если вы запускаете с флагом --pylab, что не рекомендуется: carreau.github.io/posts/10-No-PyLab-Спасибо.ipynb.html   -  person JoshAdel    schedule 24.01.2014


Ответы (2)


Я думаю, что проблема может быть связана с этим коммитом:

https://github.com/llvmpy/llvmpy/commit/b9752e1e981499879823f1f371e76b>

Вы увидите, что API для выделения изменен (второй аргумент теперь равен размеру, а не имени). Код NUMBA, по-видимому, передает имя (например, «return_value») в качестве второго аргумента. На первый взгляд, я бы предположил, что вы можете изменить все вызовы numba, чтобы передать None. Например, вот одна строка, где я получил ту же ошибку:

        self.return_value = self.builder.alloca(llvm_ret_type,
                                                "return_value")

Переключение на:

        self.return_value = self.builder.alloca(llvm_ret_type, None,
                                                "return_value")

И вы получите правильное поведение.

person user2213228    schedule 26.01.2014
comment
Переключитесь на тег 0.12.1 llvmpy git co 0.12.1 перед его сборкой и установкой. - person user2213228; 26.01.2014
comment
Переключение на 0.12.1 git checkout 0.12.1 перед сборкой llvmpy, а затем numba устранило проблему. Приведенный выше пример теперь работает без ошибок. Спасибо. - person user3230304; 26.01.2014

Этот код работает для использования Numba 0.11.1 из дистрибутива Anaconda на OSX. Какую версию вы используете? Вы сказали, что устанавливали с помощью инструкций на github, но для этого есть несколько вариантов. Кроме того, каков результат этого небольшого изменения (возможно, вам придется еще что-то настроить, например, удалить оператор return, чтобы заставить его работать):

from numba import autojit, typeof

@autojit
def trial(a,b):
    print typeof(a), typeof(b)
    return a+b

print trial(1,1)

Я получил:

int int
2
person JoshAdel    schedule 24.01.2014
comment
Я добавил некоторые разъяснения выше, чтобы ответить на ваши вопросы. Спасибо. - person user3230304; 24.01.2014