Сообщение об ошибке в lme4::glmer: «что» должно быть строкой символов или функцией

У меня многоуровневая модель. Я использую следующие команды с validatedRS6 в качестве результата, random в качестве предиктора и clustno в качестве переменной случайных эффектов.

new<-as.data.frame(read.delim("BABEX.dat", header=TRUE))
install.packages("lme4")
library(lme4)
model1<- glmer(validatedRS6 ~ random + (1|clustno), data=new, family=binomial("logit"), nAGQ = 1L)

Однако я получаю следующую ошибку

Ошибка в do.call(new, c(list(Class = "glmResp", family = family), ll[setdiff(names(ll), : 'что' должно быть символьной строкой или функцией

Я абсолютно не знаю, что пошло не так, и искал в Интернете. Извините, но я не могу предоставить данные, так как они взяты из вмешательства, которое еще не опубликовано.


r lme4
person user2958392    schedule 05.11.2013    source источник
comment
Вам нужно как минимум опубликовать результаты str(new). (Кроме того, но, вероятно, по касательной, вам не нужно оборачивать as.data.frame результаты read.delim.)   -  person IRTFM    schedule 06.11.2013
comment
Я могу воспроизвести это, просто имея переменную с именем 'new' в моей глобальной среде. Починю. Обходной путь: new2 <- new; rm("new"); glmer(..., data=new2, ...)   -  person Ben Bolker    schedule 06.11.2013

Ответы (1)


arrow_upward
4
arrow_downward

(расширено из комментария).

Поздравляем, вы нашли ошибку в lme4! Теперь это исправлено:

https://github.com/lme4/lme4/commit/9c12f002821f9567d5454e2ce3b78076dabffb54

Это вызвано наличием переменной с именем new в глобальной среде (глубоко внутри кода lme4 использует do.call(new,...) и находит вашу переменную new, а не встроенную функцию new).

Вы можете установить исправленную версию с Github, используя devtools::install_github() (но вам понадобятся инструменты для компиляции и т. д.). С другой стороны, есть очень простой обходной путь — просто назовите вашу переменную как угодно, кроме new (вы не можете просто скопировать ее, т. е. new2 <- new — вы также должны убедиться, что старая версия удалена (rm("new"))).

person Ben Bolker    schedule 06.11.2013