Я только недавно начал работать с ImageJ (и, следовательно, у меня нет большого опыта в программировании макросов), чтобы анализировать мои микроскопические изображения. Для создания попиксельных изображений FRET, скорректированных на спектральное просачивание, я использую подключаемый модуль: pixFRET. Для работы этого плагина требуется стек из 3 образов: FRET, Donor, Acceptor. Пока приходится открывать каждую картинку самому, а это ОЧЕНЬ неудобно для больших временных стеков (>1000 изображений). Я ищу способ зациклить плагин или создать какой-то макрос для этого.
Краткое описание моей структуры данных: workfolder\filename_t001c1 (изображение канала 1 — донор в момент времени 001), имя_файла_t001c2 (изображение канала 2 — FRET в момент времени 001), ...t001c3 (можно пренебречь) ...t001c4 ( Изображение канала 4 — акцептор в момент времени 001).
Мне пришлось бы создавать стек C2/C1/C4 в каждый момент времени, который автоматически анализируется pixFRET (с заданными параметрами), и результат должен быть сохранен в выходной папке.
Я благодарен за каждое предложение, так как моей самой большой проблемой является зацикливание всей этой генерации стека/анализа pixFRET (сейчас могу только сделать это руководство).
Спасибо, Дэвид.