OK. Из предыдущего опыта я обнаружил, что не так много инструкций по установке rpy2 в Windows. Я понимаю, что это официально не поддерживается, но на самом деле это не так уж сложно. Через несколько шагов я покажу, что я сделал, и, возможно, другие смогут последовать этому примеру.

Эти инструкции, скорее всего, будут работать только для Python 2.7+ и R 3.2+, но, вероятно, будут работать и для R 3.0+. Я помещаю пути, которые я использовал в своей системе. Обязательно измените пути соответствующим образом:

Во-первых, убедитесь, что все предыдущие установки rpy2 УДАЛЕНЫ, прежде чем пытаться выполнить эти шаги (и, очевидно, иметь R 3.2+ перед установкой).

1. Загрузите файл .whl для r2py с здесь
2. Установите файл .whl с помощью pip install [put .whl filename here] (в командной строке) из каталога, в который был загружен файл.
3. Добавьте путь, аналогичный C:\Program Files\R\R-3.2.0\bin, к вашей переменной окружения PATH.
4. Создайте системную переменную R_HOME со значением, подобным: C:\Program Files\R\R-3.2.0
5. Создайте системную переменную R_USER с вашим именем пользователя
6. Создайте системную переменную R_LIBS_USER с путем к папке, в которой установлены/будут установлены внешние пакеты R.

Вот и все. Откройте командную строку и введите команду R. Это должно запустить сеанс R и отобразить информацию о версии.

Теперь откройте python и запустите эту строку, чтобы увидеть, сработало ли что-то или нет:

import rpy2.robjects as robjects 

Надеюсь, это поможет.

Я только что успешно установил rpy2 на 64-разрядную версию Windows 8.1 с помощью бинарного установщика с сайта http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/#rpy2. Обычно гораздо проще просто загрузить двоичный файл, чем пытаться скомпилировать пакет в Windows.

Кроме того, вы должны установить переменную окружения R_HOME (в моем случае C:\Program Files\R\R-3.1.1) перед установкой двоичного файла rpy2. В противном случае вы получите ошибку RuntimeError: R_HOME not defined. при попытке импортировать rpy2. (спасибо Ошибка R_HOME с rpy2)

Наконец, обязательно используйте %load_ext rpy2.ipython вместо %load_ext rmagic, если вы хотите использовать его в IPython. Это одна из новых функций в rpy2 версии 2.4.0.

(спасибо Записная книжка IPython и rmagic/rpy2: не удается найти модуль ri2py (OSX 10.8.5, python 2.7, R 3.1))

Мне также обычно не удавалось заставить Rpy2 работать в Windows. После нескольких часов работы с R2.15 и Rpy2 из предварительно скомпилированного бинарного файла 2.3. 4.win-amd64-py2.7, я выполнил этот вопрос и установил pyper вместо этого. Возможно, это сработает для вас, пока не будет поддержки. Я, например, хотел бы увидеть Rpy2 на ноутбуке Windows и IPython (%load_ext rmagic), но я просто не мог больше тратить на это время.

Следуя ответам выше, это то, что работает для меня

Система: Win 7-64, Python 3.6,

1. Установите R и необходимые вам пакеты

2. Установите R_HOME и R_USER в качестве переменной среды.

R_HOME = D:\Program Files\R\R-3.4.1
R_USER = Administrator 

Имя пользователя можно получить с помощью echo %username% в cmd

3. Загрузите rpy2 и установите его.

Загрузите rpy2 с http://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/

Проверьте его путь и установите его в cmd, например pip install rpy2-2.8.6-cp36-cp36m-win_amd64.whl

4. Создайте блокнот и посмотрите, работает ли он

import rpy2.robjects as robjects

# test : evaluating R code
robjects.r('''
        # create a function `f`
        f <- function(r, verbose=FALSE) {
            if (verbose) {
                cat("I am calling f().\n")
            }
            2 * pi * r
        }
        # call the function `f` with argument value 3
        f(3)
        ''')

EDIT Наконец-то мне удалось заставить его работать!!! Смотри ниже:

Я ломал голову, чтобы заставить это работать, и до сих пор не понял этого полностью. Что я узнал, так это то, что ошибка

'sh' не распознается как внутренняя или внешняя команда, исполняемая программа или пакетный файл

вызвано отсутствием mingw и Rtools (и других unix-подобных вспомогательных программ). (http://sourceforge.net/p/rpy/mailman/message/26549197/< /а>)

Я прошел этот этап, установив Rtools (http://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/) и mingw (http://sourceforge.net/projects/mingw-w64/) (Но так как проект mingw-w64 на sourceforge.net перемещается на mingw-w64.org, я предлагаю использовать mingw-w64.org)

Я прошел ошибку R.exe CMD config --ldflags, но застрял с

TypeError: объект типа «NoneType» не имеет len()

ошибка. Я все еще ищу решение!!

Надеюсь, это поможет кому-то в какой-то момент.

ОБНОВЛЕНИЕ: кажется, что есть несколько проблем, связанных с установкой. setup.py не может найти правильную версию R, и у компиляторов возникают проблемы.

Итак, как действовать:

1. Загрузите исходный код с https://pypi.python.org/pypi/rpy2.
2. Update your environment variables - In the user variables
   • PATH : append the path to ur R installation eg ;C:\Program Files\R\R-3.0.2\bin\x64
   • R_HOME : новая переменная с путем к R: C:\Program Files\R\R-3.0.2
   • R_USER : имя пользователя, например, john
3. Установите Rtools (http://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/) и mingw (http://mingw-w64.org)
4. #P12# <блочная цитата> #P13#

5. В файле unixccompiler.py либо в python27/lib/distutils, либо в моем случае C:\Users(user_name)\AppData\Local\Continuum\Anaconda\Lib\distutils строка комментария 227

компилятор = os.path.basename(sysconfig.get_config_var("CC")) с # (#compiler = os.path.basename(sysconfig.get_config_var("CC")))

и добавить строку

компилятор = 'gcc'

Некоторые другие вещи - используйте командную строку cmd для установки. Использовать

установка сборки python setup.py

Установите Rtools и mingw, приняв все значения по умолчанию. В Rtools выберите

дополнительно для сборки 64-битной версии R

а также

отредактируйте системный ПУТЬ

Вот и все!! Приступил к работе..

Надеюсь это поможет!!

На Anaconda вы можете установить, используя:

conda install --channel https://conda.anaconda.org/Richarizardd rpy2

Альтернативно можно попробовать:

conda install -c r rpy2 

Можно также обратиться:

https://github.com/conda-forge/rpy2-feedstock

Сценарий установки setup.py сообщает, что при запуске возникла проблема

"C:\PROGRA~1\R\R-215~1.2\bin\R" CMD config --ldflags

Откройте терминал, вставьте эту команду, проверьте, в чем ошибка.

Поскольку вы отредактировали вопрос с выводом, проблема, похоже, заключается в том, что при запуске этой команды в качестве подпроцесса из python setup.py install возвращается пустая строка, а при запуске команды из терминала есть вывод. Я также читаю из вывода терминала, что задействован cygwin. Может проблема в этом?

Ознакомьтесь с этим документом по установке, который я сделал по этой проблеме. https://www.academia.edu/12178754/rpy2Install

Это каталог, специфичный для установки ArcGIS, но его можно быстро портировать.