Как установить пакет R fftw3 в Ubuntu 12.04?

Я пытаюсь установить пакет fftw3 через консоль R.

>install.packages("fftw")

После этой команды он просит выбрать зеркало крана. Я выбрал зеркало крана, после чего возникает следующая ошибка:

Loading Tcl/Tk interface ... done
Warning: unable to access index for repository http://ftp.iitm.ac.in/cran/src/contrib
Warning messages:
1: In open.connection(con, "r") :
unable to connect to 'cran.r-project.org' on port 80.
2: In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) :
package ‘fftw’ is not available (for R version 2.14.1)

И когда я пытаюсь использовать fftw3, возникает следующая ошибка:

> install.packages("fftw3")
Installing package(s) into ‘/root/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14’
(as ‘lib’ is unspecified)
Warning: unable to access index for repository http://ftp.iitm.ac.in/cran/src/contrib
Warning message:
In getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib) :
package ‘fftw3’ is not available (for R version 2.14.1)

Может ли кто-нибудь помочь мне в этом?


r ubuntu-12.04 fftw
person Saurabh    schedule 13.02.2013    source источник

Ответы (2)


arrow_upward
20
arrow_downward

Как сказал Пол, это, вероятно, не пакет R. Существует пакет R, который является оболочкой для библиотеки FFTW, также называемой fftw, вы должны установить его:

Ссылка на CRAN-страницу fftw

В Ubuntu у вас все еще есть системные требования для правильной установленной библиотеки fftw, которую вы, вероятно, можете решить с помощью

sudo apt-get install fftw3 fftw3-dev pkg-config
person Daniel Fischer    schedule 13.02.2013
comment
@Daniel.. Спасибо за ваш ответ. Я уже пробовал то, что вы упомянули. Не могли бы вы рассказать мне о системных требованиях fftw3 (›= 3.1.2) на странице «Ссылка на CRAN» fftw . Как мне этого добиться... - person Saurabh; 13.02.2013
comment
Я думаю, сначала вам нужно ввести в консоль команду apt-get (это не имеет ничего общего с R, это на уровне ОС), а затем, после того, как в ОС установлены библиотеки, вы можете установить пакет R, как вы пытались, может быть, вы может попробовать другое зеркало Крана. - person Daniel Fischer; 13.02.2013
comment
@Daniel Я сделал в соответствии с вашим предложением, и установка показывает, что она прошла успешно, но все еще не работает для меня. когда я набираю команду › библиотека (fftw), возникает ошибка: пакет fftw не найден. Есть ли что-то еще, что мне нужно? делать? На самом деле в консоли R я также пробовал install.packages(fftw3), ошибка была такой: Установка пакета(ов) в '/root/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14' (поскольку 'lib' не указан ) Предупреждающее сообщение: в getDependencies(pkgs, dependencies, available, lib): пакет 'fftw3' недоступен (для версии R 2.14.1) - person Saurabh; 14.02.2013
comment
@Daniel... когда я пытаюсь установить.packages(fftw), возникает следующая ошибка: пакет 'fftw3' не найден. Рассмотрите возможность настройки переменной среды PKG_CONFIG_PATH, если вы установили программное обеспечение с нестандартным префиксом. В качестве альтернативы вы можете установить переменные среды FFTW_CFLAGS и FFTW_LIBS, чтобы избежать необходимости вызывать pkg-config. Смотрите справочную страницу pkg-config для более подробной информации. ОШИБКА: сбой конфигурации для пакета «fftw» * удаление «/root/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14/fftw» Предупреждающее сообщение: в install.packages(fftw): установка пакета «fftw» не -нулевой выходной статус - person Saurabh; 14.02.2013
comment
Вы установили инструмент pkg-config для Ubuntu? Я думаю, что пакет R использует его (и, кстати, я забыл добавить версию fftw3 для разработчиков в apt-get), поэтому, если вы установите эти две вещи также до установки пакета R, это должно сработать (я отредактирую соответственно мой ответ...) - person Daniel Fischer; 14.02.2013

arrow_upward
0
arrow_downward

На веб-сайте, на который вы ссылаетесь, рассказывается о библиотеке C, но ничего не говорится о пакете кода R. Вы ошибочно полагаете, что R может установить любой файл .tar.gz как библиотеку R. Библиотека R имеет очень специфическую структуру файлов и каталогов, и ошибка, которую вы получаете, связана с тем, что .tar.gz не соответствует этой структуре.

person Paul Hiemstra    schedule 13.02.2013
comment
Спасибо за ваш ответ .... но я также пытался сделать это, например: install.packages (fftw), но у меня все еще не работает. Эта команда просит выбрать зеркало. Я также выбрал зеркало. - person Saurabh; 13.02.2013
comment
Пожалуйста, отредактируйте свой вопрос с этой новой информацией, включая ошибки, которые вы получаете. - person Paul Hiemstra; 13.02.2013
comment
@Paul .. Согласно вашему предложению, я внес изменения в свой вопрос, надеюсь, теперь все ясно ... - person Saurabh; 13.02.2013