Ошибка: не удается скомпилировать простую программу JNI.

Когда я попытался запустить консоль r в eclipse, я получил эту ошибку:

....Please make sure that R package 'rj' (1.1 or compatible) is installed...

Итак, я попытался установить в консоли R следующее:

install.packages(c("rj", "rj.gd"), repos="http://download.walware.de/rj-1.1")

получил эту ошибку:

checking whether Java interpreter works... checking whether JNI programs can be compiled... configure: error:             Cannot compile a simple JNI program. See config.log for details.configure: error: ./configure failed for jri ERROR: configuration failed for package ‘rj’

кстати, моя конфигурация: ubntu 11.10 64bit+eclipse 3.7, и я следил за этим сообщением: http://www.twm-kd.com/linux/install-oracle-java-sdk-in-ubuntu-11-10/ для установки oracle-1.7.0-jdk, затем запустите: «sudo R CMD javareconf», получил:

Java interpreter : /usr/bin/java
Java version     : 1.7.0
Java home path   : /usr/lib/jvm/java-7-oracle/jre
Java compiler    : /usr/bin/javac
Java headers gen.: /usr/bin/javah
Java archive tool: /usr/bin/jar
Java library path: :/usr/java/packages/lib/amd64:/usr/lib64:/lib64:/lib:/usr/lib
JNI linker flags : -L -L/usr/java/packages/lib/amd64 -L/usr/lib64 -L/lib64 -L/lib -L/usr/lib -ljvm
JNI cpp flags    : -I$(JAVA_HOME)/../include -I$(JAVA_HOME)/../include/linux
Updating Java configuration in /etc/R
Done.

информация о сеансе

R version 2.13.1 (2011-07-08)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
[1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
[3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
[5] LC_MONETARY=C              LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
[7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
[9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base

r ubuntu plugins eclipse statet
person Alex Luya    schedule 12.10.2012    source источник
comment
Работает на меня. Можешь опубликовать свой sessionInfo()?   -  person nograpes    schedule 13.10.2012

Ответы (2)


arrow_upward
9
arrow_downward

Убедились ли вы, что выполнили sudo R CMD javareconf перед выполнением install.packages(c("rj", "rj.gd"), repos="http://download.walware.de/rj-1.1")?

person Vivek V K    schedule 12.07.2014
comment
Только что понял, что это сообщение 1-летней давности.: | в любом случае хорошо, если это помогает другим. - person Vivek V K; 12.07.2014
comment
Это полезно. У меня такая проблема при установке xlsx с R version 3.5.3 (2019-03-11) Rstudio Version 1.2.1335. ~~~~~~ text checking whether JNI programs can be compiled... configure: error: Cannot compile a simple JNI program. See config.log for details. Make sure you have Java Development Kit installed and correctly registered in R. If in doubt, re-run "R CMD javareconf" as root. ~~~~~~В Rstudio есть опция terminal. Просто запустите R CMD javareconf как root. Затем переустановите пакет. - person Nick Dong; 24.05.2019
comment
И Rstudio должен быть перезапущен. Тогда все работает нормально. - person Nick Dong; 24.05.2019

arrow_upward
0
arrow_downward

Удалив текущую версию 2.13, затем установив новую версию 2.15, эта проблема исчезла.

person Alex Luya    schedule 13.10.2012