Обеспечить новую строку в EOF в RubyMine

Включите параметр Обеспечивать пустую строку перед концом файла при сохранении в настройках Editor:

В RubyMine 6 или выше (в Mac OSX):

Включите параметр «Обеспечивать перевод строки в конце файла при сохранении» в настройках Editor.

В RubyMine 2016.2.1 вам нужно перейти на Preferences > Editor > General > Other > Ensure line fedd at file end on Save. Снимок экрана настроек в RubyMine 2016.2.1

RubyMine наряду со многими другими редакторами поддерживает стандарт EditorConfig для базовой конфигурации.

Вы можете применить символы новой строки в конце каждого файла, поместив файл с именем .editorconfig в корень вашего проекта:

# top-most EditorConfig file
root = true

# Unix-style newlines with a newline ending every file
[*]
end_of_line = lf
insert_final_newline = true

Можно отключить настройку для определенных типов файлов или имен файлов.