Мне нужно найти шаблон в строке заголовка моего файла и объединить следующую строку с Perl

Мой многофастовый архив в таком формате:

>miRNA65 dvex2345
CGATGCTAGATGCTATGACAACGATGCCTCG-G
>miRNA60 dvex1234
T-TAA-ACTCATCATCATCATACTCATCATCATCATCAGCATATTAACAAG
>miRNA65 dvex2345
T-TAA-ACTTATCATCATCATACTCATCATCATCATCAGCATATTAACAAG

Я новичок в Perl, и мне нужно искать равные «> строки» и объединять следующую строку, чтобы присоединиться к последовательности.

Я ожидаю следующий вывод для вышеуказанного файла:

>miRNA60 dvex1234
T-TAA-ACTCATCATCATCATACTCATCATCATCATCAGCATATTAACAAG
>miRNA65 dvex2345
T-TAA-ACTTATCATCATCATACTCATCATCATCATCAGCATATTAACAAG.CGATGCTAGATGCTATGACAACGATGCCTCG-G

Как лучше всего это сделать?


person Cristian Velandia    schedule 06.08.2012    source источник


Ответы (1)


person    schedule
comment
Большое спасибо! отличное решение. - person Cristian Velandia; 07.08.2012